不用說你那宅基地是超出房本預訂面積了，那麼超出的面積也就應該定為是違章建築的面積，違章面積那拆除的可能性就會很大。可是透過你的描述說之前超出的面積已經進行了罰款，一般在農村房屋面積的超出也是常有的事，既然已經採取了罰款解決，按說就可以到此為止了，可如今又要拆除，這就要看你處的違章情況和拆除的力度了。如果是大面積的統一的，那麼你也只好如此了，如果就你單方面的看看能否繼續多花些錢來解決，不然也只能聽候處理了。生活中許多事情都是事在人為，同時也包括臨場發揮，說實話這種問題請教也是請教不來的，也就是說現只有經過你自己的努力之後，順其自然了，因為畢竟你是違章建築。

因為你提出的問題牽扯太多，需要掌握實際情況以及你宅基地資料及處罰後有無辦理宅基地證等綜合判斷後才知道如何回答，可以給你建議自行判斷。

一：判斷原宅基是否有宅基地證

為什麼要判斷原宅基地有無證呢？

如果未辦理到宅基地證。說明該地為基本農田。

如果有證則需要重新核實你是否存在批甲佔乙的情況，也就是重新核實原宅基地是否是集體建設用地還是基本農田。

利用相關調查軟體核實土地性質。

二：判斷超面積的土地性質

如果原宅基地為集體建設用地那麼需要核實其超面積的土地性質情況，目前農村存在改擴建侵佔基本農田或者耕地的情況，為此需調查超面積的土地性質。因為農業農村局都說了輸了官司都要拆，那麼說明他們已經掌握了部分土地為基本農田或者耕地。

三：判斷對你處罰的到底是哪個部門的什麼處罰？

初步判斷既然有水務參加，說明你的房屋離水源地較近，可能是水務的處罰，則需結合你實際處罰情況。

四：改建後有無辦理到宅基地證

根據你所說農業農村局輸官司都要拆，那麼50%的可能性是你辦理到了產權證，但是該產權證有可能存在以欺騙的手段辦理宅基地證。

最後，無論哪種情況只要侵佔基本農田或者耕地該拆除的拆除，該復耕的復耕。