讀音確實一樣的，都是yi：去聲。不過字意是有區別的。

懿，意指美好德行。想想司馬炎稱帝后，給她爺爺的諡號不就是“宣帝”嗎。

乂，治理個安定的意思符合西晉完成天下統一時得形勢和局面。

司馬懿和司馬乂，相隔兩代人，現實中也不會產生衝突和不便，所以，並無不妥。

與祖上起同音字的名字的傳統由來已久。在春秋時期，有很多人起名字都是和祖上同字，或幾代人同用一個名字。

司馬懿在三國魏晉時期名氣很大。而且是以睿智聞名於世。他雖然沒有特別突出的治國才能。但謀慮，警覺，計劃都是特別擅長的。司馬氏兩代經營奠定司馬家的晉朝江山。司馬懿，司馬師，司馬昭這三位比起來，司馬懿在各方面都比兩個兒子要強很多。也是司馬氏最大的功臣。

西晉司馬炎篡魏後，晉朝面臨的問題還是氏族掌握權力的局面。藩王藩鎮擁有的權力太大。而且削藩的阻力空前的大。不然也不會有後面的八王之亂的事情發生。晉朝之所以是人們認為的黑暗懦弱大時代，和這樣的統治體系是分不開的。

司馬炎這個人還是有些頭腦的，他畢竟在耳濡目染中學習到了司馬師兄弟的權衡之術，順利的得到了江山。但憂慮還是時刻伴隨著他。

魏篡漢，晉篡魏。這樣的事已經給社會帶來很壞的影響。人人都擁權自重，野心勃勃。如果沒有像司馬懿這樣的謀慮家指掌國家的話，晉朝的江山根本不會穩定。

司馬炎深知這一點。所以他對自己的兒子期望很高，也是必然的。古人講天道輪迴，晉朝恰恰是道派盛行的時代，這種道派充實這鬼神論。司馬炎希望兒子是先賢轉世的思想也是順理成章的事情。

名諱制度在漢朝已經大行其道，不能用先人名諱已經是共識的事情了。但還有空子可鑽，就是同音。Yi，在古代通“義”，是好詞。所以用這個字可以彰顯賢王威儀。

有和“懿”同音，可謂兩全其美的辦法。司馬炎希望孩子是司馬懿轉世，又礙於禮法，這樣做也是合乎情理的。

您說的是現代漢語發音，兩個字同音。我個人認為古代這兩個字讀音很可能並不一樣。

想必您也知道曹植的兩個心腹丁儀和丁廙是親兄弟，按照現代漢語的發音，他們的名字的讀音也是完全一致。我想這是不可能的，只能解釋為古代漢語發音和現在不同。