《漆黑的魅影》全名為《寶可夢 漆黑的魅影》，是國內綜合素質及人氣最高的改版系列之一。目前遊戲仍在由製作組及內測組進行小幅的最佳化及更新，更新的方向仍然是完善漆黑所體現的五代環境。

劇情方面極具創意，在保留寶可夢的世界觀的基礎上，引入了平行世界的概念，包含遊戲世界Genera，漫畫世界Creatio和動畫世界Abando，遊戲流程達三個周目，新增了包括二週目新大陸——賽諾地區在內的大量全新的地圖，極大提高了遊戲的可玩性，包括全部歷代冠軍及反派首領在內的諸多人氣角色以及一些原創角色都在劇情流程中登場。

對戰方面新增了大量截止到第五世代的新特性和新技能，物理、特殊按照第四世代後的方法劃分，擁有相對比較完善的對戰體系，並強化了原本的遊戲難度，也新增了很多豐富的挑戰要素。

美工方面以後時代的官方版本為標準，美化了大量素材，相較於原版綠寶石有較大進步。

此外，該版本在技能動畫方面的修改在當時即使放到世界範圍也十分出眾。

改版後的主線劇情其實也是差不多的。

在固拉多蓋歐卡打完架後，需要到琉璃市左邊找到大吾

再去往後面覺醒之殿中找到米克利對話選擇天空之柱，就是裂空座所在的地方

然後前往131號道路靠近暮水鎮水路的上面海域找到天空之柱

然後一路往上，途中自然少不了各種戰鬥，記得帶好藥，然後就能見到裂空座

等帶動畫結束就可回到琉璃市開始道館戰鬥，接著就向聯盟繼續進發吧

那麼後續就是這麼多了。作為可玩性很高的一個改版，在中國寶可夢玩家中還是很有名氣的，期待還能有更多的新元素的加入。