根據陳壽《三國志·華佗傳》的記載，華佗確實是被曹操下獄拷打致死。

華佗（145-208），字元化，一名旉，沛國譙縣人（今安徽亳州）。他醫術精湛，藥到病除，尤其擅長外科治療，還發明瞭麻醉用的“麻沸湯”，因此也被譽為“外科聖手”或“神醫華佗”。

合湯不過數種，心解分劑，不復稱量，煮熟便飲，語其節度，捨去輒愈。若當灸，不過一兩處，病亦應除。

當時許多名人都曾請華佗為自己治病，基本上都是藥到病除。曹操聽說後，因為自己一直有頭疼的毛病，每次發作都心情煩悶，疼的死去活來，便派人請老鄉華佗來為自己治病。

佗之絕技，凡此類也。太祖聞而召佗。太祖苦頭風，每發，心亂目眩。

華佗知道曹操這個毛病只需要用針扎膈俞穴就會恢復。但他厭惡曹操為人，於是就告訴曹操，這個病短期內很難治，只有長期治療才能行，以此逃避治療。

後來華佗因為思念家鄉回了譙縣，到家之後，華佗寫信給曹操說妻子重病，多次請求延長假期，拒不返回許昌。

太祖大怒，使人往檢。若妻信病，賜小豆四十斛，寬假限日；若其虛詐，便收送之。

曹操三番五次請他回來給自己治療，華佗總是以妻子有病拒絕。曹操一怒之下派人前去檢視。結果曹操派的人到了譙縣一看，華佗妻子果然是詐病，於是就用囚車押著華佗，把他投入了許昌監獄。曹操知道華佗騙了自己，憤怒不已，下令進行嚴刑拷打，最後將華佗打死在獄中。

後來曹衝生病，天下只有華佗能夠醫治，曹操才覺得非常後悔殺了華佗。

真是曹操下令入獄，在獄中被拷問致死。

不過這個和《三國演義》有出入的地方。《演義》中，是曹操厚葬關羽後，患了頭疼之病，急招華佗前來救治。華佗提出要根治頭疼，需要進行開顱手術，曹操以為華佗要為關羽報仇而故意藉機加害於他，於是下令把華佗關入牢獄，急令追問拷打，華佗應該是受不住酷刑，最終身亡。

在《三國志方技傳》中，關於華佗的記載，除了高超的醫術外，對於曹操殺害華佗的原因也有記錄。

當時曹操處理事務，結果病情日益加重，於是讓華佗專門來檢查，華佗檢查過後表示，“這病很難治好，需要長年累月不斷地進行治療，可以延長一些壽命。”

既然不能一次根治，需要長時間調養，曹操估計打算讓華佗長期留在身邊，便於隨時治療。但華佗長期遠離家鄉，想回去看看，因此藉口剛剛得到家信，所以想短時回家一趟。

由於說是短時間，曹操同意了，但華佗到家後，推託妻子有病，多次請求延長留在家中的時間，而沒有及時返回。曹操多次用書信召喚，又下詔令華佗所在的郡縣徵召遣送。但華佗自恃自己的過人醫術，又厭惡在曹操手下為其驅使，於是一直不前往。

曹操大怒，也一時不知道華佗妻子真病假病，於是派人前往檢視，真病就賜糧食，寬限他在在家的時間；如果是假的，就立即押解回來。後來，華佗被押送到許昌的監獄，經拷問也認罪。

荀彧勸說曹操，華佗的醫術過人應放一馬，但曹操不同意，說“不憂，天下當無此鼠輩耶？”，意思是不要擔心，天下應該還有許多這種醫術高超的人，但華佗不聽指令，欺騙他曹操，一個鼠輩之人，可有可無。於是“遂考竟佗”，加重了拷打，華佗沒撐住，死了。

華佗撰寫的醫書想交給獄中小吏，小吏怕牽連沒敢接，華佗就把書燒了，這裡也不同於《演義》裡，明確醫書叫《青囊書》，小吏接書後，妻子卻燒燬的內容。

後來，曹操因為曹衝的死，而追悔當初殺了華佗。所以，華佗真是曹操殺死的。

曹操殺了神醫華佗是無疑的，但並非如《三國演義》中所言，因華佗要劈開曹操頭顱為其醫治頭痛之病，被曹操懷疑有加害自己之心而殺的。

其實，史書《三國志》對曹操殺華佗是有記載的。

華佗是東漢末年人，著名醫生，被譽為神醫，他醫術高超，擅長外科、針灸及疑難雜症的的診療。研製出了世界上最早的麻醉藥劑一一麻沸散。還創制了一套健身強體的保健體操一一五禽戲，相當於東漢末年的廣場舞。

華佗當時算是體制內的人，端鐵飯碗的人，相當於國家公職人員，理應服從國家徵召遣派。曹操，大漢丞相，具體化的國家象徵，聽命於曹丞相就是效力於國家。可是，華佗自恃醫術高超，不願受官府驅使，拿曹丞相不當官。以妻子生病為由，謊言欺騙曹操，曹操多次徵召不就。後來，曹操派人查得實情，一怒之下，嚴刑拷打下獄，後死於獄中。

在當時的制度、體制和社會環境下，曹操殺華佗，理所應當；華佗被曹操所殺，是不ZUO不Si。做為國家公職人員，是不懂政治，不講政治，最後誤了自己卿卿性命。

華佗是被曹操關在監獄裡困死的。

眾所周知，曹操患有頭痛的病，發作起來難以忍受，在一些影視作品中也看到過這樣的鏡頭，曹操臥床，頭戴白色繃帶，痛苦的接待來訪。華佗是當時的神醫，救濟百姓，曾經為關羽刮骨療毒的就是他，那真是妙手回春。

曹操頭痛難醫，請來神醫華佗醫治，華佗給出的診斷是曹操腦袋裡漲了東西，需要進行開顱手術，從這一點看，華佗的醫術確實高超，當時的醫療水平很超前。

曹操是個疑心很重的人，尋思著，這是要我的腦袋，因此，就把華佗關了起來，他頭不痛，當然，想不起來神醫，當犯病後，想起華佗時，神醫已經被困死在了監獄，可惜神醫死得太冤了。

曹操，現在評價他是政治家，文學家，軍事家，偏偏對於醫學他是不懂得，加上疑心大，害死了神醫。

歷史上，華佗確實是被曹操殺死的，在跟隨曹操之前，華佗就已經很有名了，有很多官員徵召他，並非是去做醫生，而是去做官，但他自詡清高，並未答應他們，史載：

“沛相陳珪舉孝廉，太尉黃琬闢，皆不就。”

所以大家可能有些誤會，華佗並非只是一個醫術高明的醫者，而是一個有點像司馬徽、盧植那樣的高人名士，醫術只是他的一大愛好罷了。

可就這麼一位清高的名士，最後卻跟著老曹走了，還是以醫者的身份，要知道，在東漢末年，醫者的地位非常低下。

曹操患有頭風病，所以招來華佗目的也很明確，就是為他醫治，做他的私人醫生。

大家想想，其他地方的官員是以士人的身份去請華佗都不從，更何況曹操總是把他視為一名地位低下的醫者呢？向來清高的華佗忍得了一時，不可能忍得一世。

所以華佗最後死了，死於他的清高和不順從。

華佗不想只做曹操的私人醫生，便以妻子生病為名請了探親假，結果一次次延長假期，最後老曹實在忍不住了，讓人去檢視，發現華佗在騙他，這下激怒了曹操，於是將其下獄，判了死罪。荀彧為他求情，卻被曹操否決了。

“於是傳付許獄，考驗首服。荀彧請曰：“佗術實工，人命所縣，宜含宥之。”太祖曰：“不憂，天下當無此鼠輩耶？”遂考竟佗。”

荀彧以華佗醫術高明，世人需要他這樣的名醫為名向曹操求情，卻並未解了曹操的心頭之恨，世人的命能有我的命重要嗎？華佗惹得老子不爽，就該殺。

於是華佗就這麼被殺了，曹操是一時爽了，頭風病雖然發作起來很難受，但畢竟是慢性病，一時半會兒死不了，但事實上不久他就要為這次濫殺無辜埋單。

曹操最喜愛的兒子曹衝患病，遍尋名醫最終不治而英年早逝，這個時候曹操想起了被他殺死的華佗，說：

“吾悔殺華佗，令此兒強死也。”

說啥都晚了，當初若不殺華佗，也許曹衝真的就不會死了，那麼曹衝如果長到成年，很可能就有和曹丕爭奪儲位的能力了，曹魏乃至三國的歷史很可能就是另一個模樣了吧。