1、育苗肥：保護地栽培的芹菜一般都要經過育苗，然後再定植。營養土的配製可以按體積比用1/2的菜園土與1／2的腐熟或半腐熟堆肥混勻後做營養土，並按重量的2-3%摻入過磷酸鈣。在出苗後30天左有，酌情追施一次低濃度氮肥，每畦追施硫酸銨0.2公斤或腐熟的稀人糞尿。

2、基肥：由於芹菜根系淺，栽培密度大，在定植前整地時一定要施足底肥。每畝施入4000-5000公斤有機肥，30-35公斤過磷酸鈣。25-20公斤硫酸鉀，對於缺硼土壤每畝可施入1-2公斤硼砂。

3、追肥：一般在定植後緩苗期間產追肥，緩苗時植株生長很慢，為了促進新根和葉片的生長，可施一次提苗肥，每畝隨水追施10公斤硫酸銨，或腐熟的人糞尿500-600公斤。從新葉大部分展出到收穫前植株進入旺盛生長期，葉面積迅速擴大，葉柄迅速伸長，葉柄中薄壁組織增生，芹菜吸肥量大，吸肥速率快，要及時追肥。第一次每畝追施尿素7-9公斤或硫酸銨15-20公斤，硫酸鉀10-15公斤。第一次追肥半月以後，芹菜進入旺盛生長期，細小白根佈滿地面，葉色鮮綠而發亮，葉面出現一些凸起，這時進行第二次追肥，用量與第一次相同。再過15天左右進行第三次追肥，肥料用量與第一次相同，或視芹菜的生長情況增加或減少肥料用量。

氮肥和鉀肥每次施用量不宜過多，土壤中氮、鉀濃度過高會影響硼、鈣的吸收，造成芹菜心葉幼嫩組織變褐，並出現幹邊，嚴重時枯死，在灌水不足、土壤乾旱和地溫低時更加嚴重。所以要控制氮肥和鉀肥的用量，增加硼肥和鈣肥的施用，保持土壤溼潤，避免土溫過低。在植株缺硼時還容易產生莖裂，莖裂多出現在外葉葉柄的內側。心葉發育時期缺硼，其內側組織變成褐色，併發生龜裂現象。

1、氮肥。芹菜適宜多施氮肥，但不宜追施尿素。芹菜在整個生長期間需要大量氮素肥料，追肥要以碳酸氫銨為主。做到少量多次，一般需追肥2-3次。但要注意，芹菜不宜追施尿素，因為芹菜追施尿素後生長反而緩慢，纖維素增多，植株容易老化，品質降低，食用時帶有苦味。

2、有機肥。追施有機肥，可提高芹菜品質。追施漚制腐熟的雞鴨等家禽有機肥，芹菜植株柔嫩粗壯，纖維減少，品質和產量大大提高。但沒有腐熟的農家有機肥不可作追肥施用，以免引起燒蔸爛根。

3、微肥。補施微肥，可防芹菜生理病害。缺鈣會引起芹菜“燒心”,缺硼則會引起芹菜空心、葉柄開裂等生理病害。葉面噴施0.5%氯化鈣或硝酸鈣水溶液，可防止芹菜“燒心”。為防止芹菜空心、葉柄開裂，可基施硼砂0.5-0.75kg/666.7㎡，或用0.3%-0.5%硼酸溶液葉面噴施。

陽臺蔬菜澆肥法：為了衛生不產生異味，可以買一些有機肥來灑，也可以弄一些曬乾了的雞鴨牛羊糞等農家肥打底，勤澆水就行了。