中醫解剖學，腦屬於“頭面”，《醫林改錯》上介紹得比較詳細：“靈機記性在腦者，因飲食生氣血，長肌肉，精汁之清者，化而為髓，由脊骨上行入腦，名曰腦髓。盛腦髓者，名曰髓海，其上之骨，名曰天靈蓋。”這就是腦的中醫解剖記述，與現代醫學並無不同。

很多人以為腦的功能是西醫先發現的。但實際上，中醫很早就認為腦是主司思考、記憶的器官。如李時珍所言：“腦為元神之府”。金正希言：“人之記性皆在腦中。”等。

中醫還認為，“頭為諸陽之會”。人體十二經脈中，手三陽的經脈是從手走向頭部，足三陽的經脈是從頭走向足部，所以說頭為“諸陽之會”。

中醫認為，腦主身體元神及諸體之神，即所謂“頭腦為神、魂、魄、意、志會聚之所”，併為蘊藏清氣的髓海，維繫全身經絡並起協調作用等，總的來說，也與現代醫學的認識差不多，限於相關內容過多，在此不能盡述。

五臟六腑不包含腦，但其功能包含腦，比如心的功能就包含了腦的功能，“”心主神志”。腦在屬於奇恆之腑，包含腦髓骨脈膽女子胞

鈍君HGR 解釋得很清楚中醫認為腦的概念 。在現代化的解釋，奇恆之府不入五臟六腑最重要的是： 1. 五臟六腑毀坯或者失去功能，結果就是致命的。腦子失去功能，人的生命可以延續。2. 中醫認為腦子是膸海，是收藏記憶的，尤如現代電腦，貯存記憶，啟動和傳達五臟六腑營衛氣血的工作綱領和節目。3. 奇恆之府，奇指單獨的；恆指不變。是藏而不瀉的器官，但藏的不是五臟的精氣。腦是髓海，是否充實強健，完全決定於腎髒精氣的盛衰。 我希望我能清楚對答你的問題。謝謝！

“心者，君主之官也，神明出焉“。本人一直認為中醫的心就是高高在上的大腦。“心包經”才是現代醫學所稱的“心”。