“第二次衝擊”作為新世紀福音戰士這部作品劇情的開端，因為“第二次衝擊”世界發生了翻天覆地的變化，而事實的真相被隱瞞成為隕石墜落南極的自然災難而被世人所接受，往後發生的“第三次衝擊”則是直接導致了地球上所有生物迴歸到生命的海洋，至於事實的真相已經沒有多大的意義，因為這個時候已經不再存在人類或者其他生命形態，而然幾乎所有人都忽略了“第一次衝擊”，實際上“第一次衝擊”才是整個新世界福音戰士故事的真正起源，最直觀地解開當中的使徒、EVA、人類的本質到底是什麼。

劇中幾乎沒有非常完整地呈現出來，只有透過美里的話簡單帶過，甚至可以說是一不小心就錯過，但當中蘊含的資訊量可以說是非常巨大，幾乎可以顛覆所有人對於EVA世界觀的認知。

地球剛形成不久時，帶著擁有產生生命功能的“生命之卵（莉莉絲）”的天體從宇宙來到地球，地球本身自古以來棲宿著的“生命之卵（亞當）”因衝擊而停止活動進入漫長的沉睡，然後原本不該誕生在這個星球上的第13個使徒——人類因墜落地球的“生命之卵（莉莉絲）”而在地球上誕生並且繁衍。

這就揭開了人類與使徒賭上生存的可能而爭奪地球支配權戰鬥的序幕，後續一系列最初被誤解的事實都能夠被一一解讀。

從劇情可以得知使徒是從亞當誕生出來，換而言之作為地球原來生命體的使徒現在要奪回這個地球的支配權這一點應該是非常容易理解，因為自己的地盤被長期佔據所以必須要奪回這個屬於自己的地盤，而人類數量眾多而且也難以消滅使徒並沒有直接向個體的人類攻擊，因為這是毫無意義而且浪費時間，只有直接向第三新東京市封印在最終教條下的莉莉絲動手才有可能達成這一個目的。

為何總有使徒出現而且還絡繹不絕的往第三新東京市進發，顯然使徒早就已經知道莉莉絲的藏身之處否則就只能夠到處亂竄，但每一個使徒從被NERV發現那一刻開始目標都是非常的明確——第三新東京市，理所當然就是NERV總部最底層封印在中央教條的莉莉絲，這就是使徒的最終目標，清除這個不屬於地球的外來物。

使徒的出現地各不相同但無一例外都是往NERV總部進攻，表面上來看EVA系列似乎是充當了莉莉絲的擋箭牌，其他NERV支部幾乎沒有受到多少使徒的攻擊，越來越多的EVA系列機體最終集中到第三新東京市也並無道理，畢竟需要應付使徒越加頻繁的襲擊，而且還可以更好的掩飾事實的真相，到最後使徒進攻第三新東京市的理由被絕大部分普通人所接受，而背後的SEELE還有碇源渡對“人類補完計劃”各懷鬼胎。

假如說“第二次衝擊”是一場浩劫的話，那“第一次衝擊”毫無疑問是新生，而引發“第一次衝擊”的那個天體正正就是墜落在第三新東京市這個位置，顯然對外宣稱是天然形成的巨大地下空間，實際上這就是當時天體撞擊造成，而最初這裡被發現的不僅僅是這一個巨大的地下空洞還有人類和EVA的始祖——莉莉絲。

而造成“第一次衝擊”的天體也並非是完全墜落到地球上，這個天體還有絕大部分物質形成外太空的月球，這樣就構成了非常穩定的天體結構，同時原來地球上的亞當受到衝擊陷入沉睡，也是為後來人類能夠長時間進行繁衍提供了條件。

其實一開始SEELE和NERV就給主角碇真治他們下套，才成功將其騙進了EVA的駕駛艙，甚至一度讓人懷疑這些使徒到底是不是外星來的生物，最終是為了消滅人類才最終襲擊第三新東京市，而然真實情況卻是如此的翻轉，本來不應該存在地球上的生物反倒成為了這個星球上的主人將原來的居住者進行驅逐。

因為“第一次衝擊”導致原本屬於這個地球的“生命之卵”亞當陷入了無限期的沉睡，才有了人類之後的繁衍，只不過擁有“智慧之果”的人類卻透過裹死海文書的記載尋找到亞當的存在，渴望獲得“生命之果”——S2機關的人類最終還是意外地喚醒了在沉睡之中的亞當，儘管經過努力最終還是無法阻止亞當的甦醒，在經過莫大的犧牲之後最終將其還原成為胚胎狀態。

一直覬覦著這個星球上擁有的“生命之果”的人類，幕後的SEELE謀求著這個星球所有生命體的完全融合，當然第二次衝擊並非是他們的願望，只是他們根據裹死海文書內容制定行動的一次重大失誤，往後才有製造EVA來對付從亞當身體誕生的使徒這樣種方案。

實際上知道“第一次衝擊”真相的人可以說是少之又少，在EVA世界中幾乎所有人都被虛假的事實所矇蔽，最後使徒被消滅然後亞當和莉莉絲也最終融合，地球上的所有生命體重回到黑之卵之中等待到適合時候再重新歸來，一切都還是按照裹死海文書的計劃發展，在歷史背後掌握著一切的那部分人最終還是成功地實現了他們所想的人類補完計劃。

簡單說，第一次衝擊帶來人類和世間生物，第二次衝擊帶來使徒和莉莉絲改造的eva初號機那些，第三次衝擊eva完全覺醒，世界毀滅。

很多人被“衝擊”這兩個字誤導了，EVA裡所謂的“衝擊”並不是真的指某種碰撞，而是由使徒生命體引起的全球大規模生命滅絕事件。首先，在史前地球，一顆隕石撞擊地球，隕石中包裹著一顆球型物體，後世稱之為白之月，而被定義為第一使徒亞當的發光巨人就存在於白之月中。在漫長的時間中，亞當衍生出了新的生命體，這些便是使徒。也就是說，使徒才是這個地球最開始的生命。但是就在亞當譜系的生命體在地球上“過上了辛福快樂的生活”之後，又有一顆更大的隕石撞擊了地球，這顆隕石同樣包裹著一顆圓球，後世稱為黑之月，黑之月沉入了後來日本新宿所在的位置，包裹它的隕石由於過於巨大，沒有全部融入地球，墜落爆炸之後很多碎片被地球彈開，被其中一塊被地球引力捕獲，成為了月亮。但是這次撞擊帶來的巨大能量和隨之而來產生的劇烈地質變動，使得亞當誕生的第一代生命體進入了休眠期，這些生命體便是使徒。與此同時，黑之月中也有另外一個巨人的存在，但是她在撞擊中受損嚴重，從她的傷口處源源不斷的流出橙黃色的“血液”，這種液體被後世人類稱為LCL溶液，源源不斷流出的液體經過漫長的時間，匯聚成了地球上的原始海洋，包括始祖人類在其內的全部現有生命也從海洋中誕生、進化、爬上陸地，形成了目前的地球生態環境，而那個創造了新生命的巨人，被稱為莉莉絲。最後，這次帶來第二代生命，並滅絕第一代生命的鉅變，被稱為第一次衝擊。這也是為什麼在EVA的定義裡，每次衝擊都標誌著新生命的誕生，舊物種的滅亡

是不是都想複雜了？第二次衝擊不是西里秘密中的一部分，在tv版中是課堂上老師教學內容，對標的就是造成恐龍滅絕的隕石撞擊為第一次，政府對民眾的說法是南極遭受了隕石撞擊為第二次衝擊。