小麥黑穗病是真菌引起的一種病害發生較為普遍。透過種子、肥料、土壤等帶菌傳播侵染。是小麥上的重要病害。加強種子檢疫及消毒處理是關鍵。可用石灰水浸種 用優質生石灰0.5kg，溶在50kg水中，濾去渣滓後靜浸選好的麥種30kg，要求水面高出種子10―15cm，種子厚度不超過66cm，浸泡時間氣溫20℃浸3―5天，氣溫25℃浸2―3天，30℃浸1天即可，浸種以後不再用清水中洗，攤開晾乾後即可播種。也可用藥劑拌種 用種子重量)63%的75%萎鏽靈可溼性粉劑拌種，或用種子重量0.08%―0.1%的20%三唑酮乳油拌種。也可用40%拌種雙可溼性粉劑0.1kg，拌麥種50kg或用50%多菌靈可溼性粉劑0.1kg，對水5kg，拌麥種50kg，拌後堆悶6小時，等方法防治。　　

田間發現病株，及時拔除，並深埋處理。　　

嚴格播種管理。按季節播種，同時要了解播種時期的氣溫情況。掌握播種的最佳時間。促進幼苗出苗率，減少病菌侵染的機會從而減少發病。有這種病的田地要2-3年替換播種，同時要施腐熟的土肥。

藥劑拌種。小麥種子要經過拌種或包衣處理後才能播種:1.3%苯醚甲環唑種衣劑，100-200毫升拌麥種100公斤。2.5%咯菌腈懸浮100-200毫升拌麥種100公斤。3.2%戊唑醇幹拌劑或溼拌劑100一150克拌100公斤左右麥種。

病田土壤處理。每畝用70%甲基硫菌靈可溼性粉劑或50%多菌靈可溼性粉劑1-1.5公斤，拌細土45-50公斤，均勻撒在麥田裡，然後翻耕攪勻。

拌種前準備好拌種藥劑和拌藥的工具；首先將麥種倒在乾淨的水泥地上，或地上鋪好乾淨塑膠布，把藥劑量好後，倒入容器中，按配比加入適量的水調配好藥液；然後均勻的噴灑在麥種上，再用工具將麥種攪勻後攤開晾乾，選好合適的日期播種。

黑穗病應該以預防為主:1.咯菌清或者苯醚甲環唑拌種處理2.孕穗前噴霧苯甲嘧菌酯或者苯甲丙環唑或者苯甲吡唑醚菌酯等藥劑3治療的話用烯唑醇三唑酮等藥劑治療，配合葉面肥