元朝滅亡後，孛兒只斤·脫古思帖木兒率領元朝參與力量北返蒙古，此後大明為了徹底消滅北元殘餘勢力，朱元璋多次出兵北伐，北元一退再退。捕魚兒海之戰可以說大明朝廷對北元朝廷的最後一次大規模進攻，至此北元殘餘主力被徹底消滅，黃金家族後裔徹底喪失了對蒙古諸部的統治。

捕魚兒海之戰經過

在大明的多次進攻下，北元朝廷不斷戰敗北撤，在此過程中，納哈出等蒙古部落已經逐步脫離了北元朝廷的控制。“金山之役”之後，納哈出降明，但朱元璋認為消滅這些已經相對獨立的蒙古諸部意義不大，因此將目光再次定格在了脫古思帖木兒身上。

脫古思帖木兒在遭到明軍多次打擊，且多個蒙古部落背離自己之後，率領北元小朝廷遊牧到了喀爾喀河、貝爾湖、克魯倫河一代，託庇於此地的哈赤溫後裔。

洪武二十一年（1388年），在偵查清楚北元朝廷所在地後，藍玉率師十五萬北進，將士們“人不卸甲、馬不離鞍”的向捕魚兒海（貝爾加湖）挺進。

同年四月，藍玉大軍進入沙漠，幸好大軍攜帶有蒙古軍官充作嚮導，從而解決了難以尋找水源的問題。

十一日，藍玉大軍抵達距離捕魚兒海四十餘里的白眼泉，卻突然失去了敵蹤，藍玉一度以為敵人嗅到了蛛絲馬跡從而提前逃走了，於是便想撤兵。但在定遠侯王弼的勸阻之下改變了朱藝，決定留在原地繼續偵查。

次日，明軍搜尋至捕魚兒海南岸，並在此地稍事休息。這時，斥候偵得情報，在捕魚兒海東北方向八十餘里處發現北元小朝廷。藍玉立即出兵，以王弼為先鋒，“銜枚卷甲”隱蔽前進，直撲敵軍。

脫古思帖木兒所率領的北元小朝廷以為明軍不熟悉地形，且難以找到水源，絕不會這麼快殺到，因而防備極為鬆懈。就在明軍殺來之際，隱帝計程車兵還在牽馬備鞍、整理自重。

明軍在大風沙的掩護下，甚至不鬼不覺的接近敵營，突然發動襲擊，猝不及防的北元軍隊頓時亂作一團，混亂中被殺死數千人，七萬七千多人投降，同時明軍俘獲四萬七千匹戰馬、四千八百四十頭駱駝、十一萬二千四百五十二頭牛羊、三千餘量各式車輛和一大批後勤輜重。

主力潰散之後，太尉蠻子與太師哈剌章卻仍在竭力抵抗，但不久後亦戰敗，蠻子被郭英當場殺死，哈剌章所部“一萬五千八百三戶”與“馬驢四萬八千一百五十餘匹”被俘，哈剌章本人下落不明。

此次戰役，王保保留下的元軍殘餘主力被徹底消滅，已故君主愛猷識理達臘的妻子、現任君主脫古思貼木兒的后妃及次子地保奴、公主等大批皇室成員和達官貴人二千九百九十九人被俘，北元小朝廷就此徹底消失。

捕魚兒海之戰，蒙元損失十萬人左右。而明軍的損失卻是微不足道，可以說是“不費寸兵，以收其效。” 最重要的是，北元朝廷的號召力在此戰後徹底喪失，蒙古各部落從此逐漸徹底分裂，並最終分裂為了韃靼和瓦剌兩大勢力。

北元“主力”為何如此“不堪一擊”

明軍此戰為何能以微不足道的損失大敗北元“主力”，我認為主要是由於以下三點原因造成的：

1、這支“主力”早已不復從前。北元的“主力”雖然多大十萬，但實際上這支軍隊早已不是馳騁天下的蒙古鐵騎，只不過是北元的殘兵罷了。尤其是在大明多次北伐之下，這支部隊遭遇了太多的戰敗，這支部隊的戰鬥力已經早已不復從前。

2、明軍的進攻出其不意。從戰爭經過來看，元軍對於明軍的出現根本沒有防備，他們根本就沒料到明軍會如此輕易的跨過沙漠，並如此迅速的找到在不斷遷徙中的北元主力，更不會料到這麼巧的出現大風沙，給了明軍最好的掩護。因此，元軍可以說完全被殺了個措手不及。

3、戰鬥意志薄弱。這群長期生活在中原的蒙古騎兵，可以說已經喪失了曾經的血性，從中原的花花世界遷到荒涼無比的沙漠草原，這群人能否很好的適應實在是個問題。而這些問題最終導致了這支部隊戰鬥意志方面的問題，從其被殺數千，投降卻高達七萬多就可以看出，這些士兵顯然是沒有什麼戰鬥意志的。

北元同大明的最後大決戰，史稱“捕魚兒海之戰”。此戰北元最後一支精銳被明軍消滅，北元的皇妃和一部分皇室成員被俘虜，藍玉見此情此景，想到了當年宋朝皇室所遭受的恥辱，於是藍玉便在北元皇妃為宋朝皇室討回了公道，真是感嘆風水輪流轉。

而這場戰役可以取得如此勝利，其實一點也不奇怪，當時的北元已經是不堪一擊了，是明軍主動出擊去尋找並尋求就會殲滅北元殘餘的。當時明軍最大的困擾是惡劣的環境和不知道北元軍隊的大致位置，明軍在當時實力絕對是佔優的，北元軍隊是一路敗北。在被逐出中原之後，北元的文明程度急速下降，當時已經是連一口鐵鍋都無法生產，更不要說武器裝備的生產，北元也幾乎是又回到了最初牧馬的時代。這種影響是十分大的，加上北元軍隊在中原待久了，早就沒有當年蒙古大軍的戰鬥力了。而明軍又是一支裝備有先進火器的軍隊，自然打敗北元軍隊是簡簡單單。並且這場戰役之後，藍玉也是直接封為名將了，這場戰役的解決了明朝的北方大患，而靠的主要是藍玉那驚人的判斷力，加上藍玉過人的膽識。藍玉立下如此大功之後，朱元璋居然允許藍玉在自己面前居功自傲，可見朱元璋對藍玉的器重，只是太子朱標不幸去死，否則藍玉是沒必要死的。畢竟殺藍玉，其實主要是為朱允炆即位掃除障礙。