魚缸的潔淨程度，對魚的壽命，有很大的關係。所以，魚缸的清洗、消毒，是非常關鍵的問題。

魚缸清洗注意以下事宜：

一、清洗缸壁 魚缸用了一段時間都會在玻璃壁上產生汙垢甚至苔蘚，可以用磁刮器將魚缸玻璃上的苔蘚和圬垢方便地刮乾淨。

二、清洗過濾系統 對於過濾系統的清洗，第一層是過濾棉，第二層是生化棉，第三層 玻璃環（陶瓷環、生物石等），第四層 活性炭（吸氨石、麥飯石等）。

第一層是屬於物理過濾，主要是將水中的固體殘渣阻擋住，所以特別容易髒，清洗也是以這一層為主，其他幾層通常很少清洗，常洗反而容易失去硝化菌。清洗時，一是要注意切不可搓洗，也不必要求洗得過分乾淨，更不可直接用自來水洗，可以藉助於魚缸換水的機會，使用換出的水進行清洗，否則附著在濾棉上的硝化細菌會被您徹底消滅，以至失去生物過濾的作用。

三、魚缸的消毒 給魚缸消毒可以用高錳酸鉀液，高錳酸鉀，又稱ＰＰ粉，為強氧化劑，遇有機物即放出新生態氧，有殺滅細菌作用。其殺菌力極強，常用濃度為1：2000—1：5000，（即1克高錳酸鉀加2L~5L水）的溶液沖洗。

注意的是，在配製溶液時要考慮時間，高錳酸鉀放出氧的速度慢，浸泡時間一定要達到5分鐘才能殺死細菌。配製溶液要用涼開水，消毒後用水稍加清洗即可使用。

魚缸的玻璃上常會黏附水苔等汙物，因它會影響魚兒的生長，所以一定要設法清除。清除時，可用特製的長柄夾夾住刀片來刮除不潔黏附物，刮落在箱底的不潔物，可用塑膠吸管吸收，為防止缸底的沙也被吸出，吸管口部可安一個適合的網子。