節目組解釋道，之所以提前給兩位選手音訊素材，是因為在彩排時發現兩位選手現場記憶效果不佳。節目組對提供錄音的時間進行澄清，稱提前十天給兩位選手五十條錄音的素材，直到播出前兩天（1月6日）才將範圍縮小到十五條，所以選手的錄音記憶時間非常短。同時，節目組宣告，所有的素材的交接都是在兩位選手知情並同意的前提下進行的，兩人走賽前並未提出異議。

3、逆序盲擰不算違規

林愷俊認為，在自己和賈立平提前十幾天拿到打亂公式的前提下，使用逆序盲擰是作弊行為。但是節目組卻認為，《最強大腦》並非專業的魔方比賽，有自己的特殊規則，所以逆序盲擰不算作弊。

4、同意重賽是為了避免爭議

林愷俊曾透露，錄製結束後，節目組決定重賽並與自己進行協商，但是拒絕自己提出的比分清零條件，最終雙方協商失敗，沒有進行重賽。

對於決定重賽的情況，節目組也給給予自己的說法，同意重賽並非因為專案不合理，而是為了保證國際賽不能出現實力懸殊，也為了避免環節中逆序盲擰所引起的“專案設計不嚴謹”的爭議。

據網傳林愷俊與節目組聊天截圖顯示，林愷俊並未同意重賽規則。但是《最強大腦》的官方宣告卻提到，節目組曾於11日下午與兩位選手當面確認重新錄製的規則，林愷俊同意重賽規則，卻並未出現在重賽錄製現場，所以節目組只能宣佈林愷俊自動放棄比賽。

5、節目組從未用違約金威脅選手

節目組爆料，林愷俊曾在比賽後表示自己從未認可過專案，只是迫於十萬元違約金的壓力，才繼續參與比賽。節目組稱林愷俊從未與導演組探討過十萬元違約金的問題，節目組也從未就此脅迫林愷俊不得退賽。

對於《最強大腦》的這份官方宣告，有網友認為這是節目組為了挽回信譽而緊急炮製出的一份解釋，宣告中漏洞百出，解釋不通的地方便以“節目有特殊規則”來搪塞。還有人糾結於林愷俊當時是否同意重賽規則，如果曾經同意參與重賽，那麼未出現在錄製現場顯然是錯誤的行為。也有網友將注意力放在十萬元違約金上面，認為這可能是造成幾方爭吵的深層因素。

非常大腦應該是與其他綜藝節目有區別的節目 ，因為他是一個打著科學的旗號的現場直接對抗，並當場反映對抗結果的節目。有一期節目被觀眾暴出破綻，節目組說是放彩排影象，這與假唱有何區別。

《最強大腦》頻爆黑幕，王昱珩憤然退賽是難得一股清流。縱觀《最強大腦》幾季以來，小編最喜歡的就是“水哥”王昱珩了，不僅僅是因為他過目不忘、聰慧過人的頭腦，還有他自帶沉穩的氣場，卻不想從第一季到第四季的一路走來，“水哥”竟然慘遭節目黑幕，於是他憤然退賽，粉絲表示：這樣的節目配不上你。

其實關於這些偏娛樂性質的節目，有黑幕也不是什麼奇怪的事情了，這就像一個微型的社會一樣，而在這充滿虛假、浮躁的社會中，王昱珩顯然成了這其中的一股清流。

關於“水哥”的稱呼，來源於他在《最強大腦》的第一期參賽專案是微觀辨水。從520杯一模一樣的水杯中選出評審挑選出的那一杯，所有人都在猜想到底要怎麼做到的，甚至有人懷疑他會採取什麼做法。可是，當他快速幾乎是一眼“掃”過300多杯水，然後篤定其中一杯水時，所有人都被震驚了。他說自己並不是最強大腦，只是比別人有閒工夫靜下心來看一些東西，他連炫耀都是這麼不動聲色。

當陶子問他視力如何時，他回答很差，卻並未多言。他說等打分結束之後再說，不然會有搖尾乞憐之嫌。而事實上，他的右眼已經嚴重受傷，隨時會導致失明性青光眼。他說的很平靜，就好像在講別人的故事一樣，可是他卻沒法把這些話說給女兒聽。