《駭客帝國3》主要說了面對如潮的電子烏賊，人類城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲與入侵者決一死戰，裡面的人生活在計算機網路，他們的世界其實是虛擬的。電影主要劇情講述了“救世主”尼奧的身體和思想得到分離，後者再度陷入到“母體”中，墨菲斯和崔妮蒂也不得不帶著尼奧的身體，回到“母體”和守護天使一起尋找他，一場大戰之後，守護天使、病毒雙胞胎等皆陣亡，而尼奧卻在找到先知之後一無所獲，錫安的局勢越來越危險，議員及指揮官相繼陣亡，而被叛徒射瞎雙眼的尼奧，依然想透過希望去實現預言，而這時，特工史密斯控制了先知，並變得越來越強大，威脅到了整個“母體”的穩定。在返回錫安的途中，飛船遭到電子烏賊的突襲，崔妮蒂死了，重傷的尼奧被帶到機器城市，在和機器的談判中，尼奧答應為了人類和機器的共同利益，去消滅史密斯，於是，“母體”又面臨著一次翻天覆地的“過載”。結尾的地方也是最意味深長，建築師和Oracle達成了共識，決定給予Matrix中的人類以自由意志，可以選擇在機器中享受虛擬的平靜和快樂或者選擇現實的殘酷和真實，這是個基督教新教當中非常重要的命題，上帝認為一個有自由意志的但是同時可能帶來罪惡的世界，要比一個沒有罪惡但同時也沒有自由意志的世界更符合他的期望。正是這種認識，強化了西方文化中對自由的追求和認同，成為現代西方普世價值的核心。

兩種可能

第一可能，所謂的現實世界實際上還是虛擬世界，上帝需要尼奧來幫助他完成矩陣革命。

第二可能，人類被養殖在母體中，可能身體的一部分被機械改造，特別是大腦部分，電影中的人體表面藉口就可以看出來，幫助尼奧及時在瞎眼的情況下感知到其他東西，甚至擾亂電子章魚的程式導致其爆炸，但是本身是不能像在虛擬世界一樣力大無窮，自由飛行的

尼奧的能力（許可權或悟性一直在提升）駭客1完成了在母體基礎構架上的許可權突破，獲得了非常理的能力。駭客2繼續突破許可權，並且在所謂現實的場景中也有了超常理的突破。其實這時就已經說明，所謂現實只不過是更深一層的母體系統。直到駭客三，尼奧與母體直接對話的內容，其實母體構建了多層現實，來應對不同人類的大腦反應。有些人類個體天生就是有這種突破第一重現實的能力，所以母體不斷的重構和適應，經歷了很多代的升級後，尼奧出現了。 駭客帝國，表達了兩種智慧方式的不同，一種是人類智慧，很不穩定很活躍，善於超常規。另一種是機械智慧，建立在強大的計算和規則控制上，但是一旦有疏漏，就要從修改根底的初始資料開始重建。大概想到的就這些吧。

七重外殼，王晉康的科幻小說可以看一下。

對於現代作業系統來說，普通使用者程式工作在ring3，而作業系統工作在ring0。ring0能夠完成的很多操作，對ring3來說就是魔法一樣的存在。比如ring0可以把ring3的程式暫停，加速，減速，刪除，改資料，等等。而ring3根本察覺不到。

而利用系統的bug，某些使用者程式可以把自己提升到ring0級，那就成神了。

然而你的作業系統，可能只是一個虛擬機器。虛擬機器的管理系統，跑在ring-1層。你在作業系統裡的各種神操作，不過是虛擬機器管理系統看管下的小把戲。

而在世界駭客比賽中，利用系統的bug，跑在虛擬機器裡的程式可以突破限制，獲得對虛擬機器管理系統，也就是宿主機的控制！宿主機可以讓整個虛擬機器暫停，重啟………這就是超神了。

可是天外有天，神上有神。近幾年陸續爆出，ring-1上邊還有ring-2，ring-3。其中intel自己的處理器管理系統就工作在ring-3層。牛B哄哄的作業系統，虛擬機器管理系統，自己還不知道正被intel im系統監管著。

後來又有了ring-4的傳說……

用個電腦系統打比方。。。

你在電腦裡裝了個虛擬機器

虛擬機器裡跑了個小遊戲

後來發現這個小遊戲有病毒(主角)

就給虛擬機器裝了個殺軟(愛隆王[呲牙])

然後病毒感染了虛擬機器(以為的真實世界)

其實虛擬機器還是個程式。。。

尼奧超能力就是修改母體的程式，他在矩陣裡上天入地的表現都是基於對母體程式的修改、對規則的無視。


根據電影后期的說明，這個能力實際上也是母體賦予尼奧的，相當於系統裡的高階許可權。


而現實中尼奧可以對抗機械章魚我覺得主要也是因為機械章魚本身也是母體制造的。
雖然是在現實中但依然收到了尼奧的腦波影響。

哪有現實，尼奧以為是現實，以為是22世紀，以為拔掉插頭，掙脫營養管，離開母體，回到錫安，就是衝破虛幻回到現實世界。

其實物理現實世界中已經是快8000世紀，不是8000年代，是8000世紀，尼奧和先知們，甚至機器世界之神，都以為自己才是真正知曉底層真實世界，其實，他們全部都是被虛擬的生命體，它們各自認為的真實的物理世界，是一層層巢狀不知多少層的虛擬世界。

而這個世代，物理現實世界，已經根本是能量體的世界，有源自人類和類人生物的意識體演變進化而成的，也有起源於機器文明的能量流超意識體的進化單元，統合為一個世界主宰群，它們按照自己的構想和研究方向的需要，任意設定層層細化巢狀的虛擬世界，

我們的現實，就是其中不知深幾層的一個虛擬宇宙團

人類在研究人工智慧技術過程中，透過矽晶片始終不能突破軟體程式設計、演算法設計時始終不能突破人類智力侷限。

某國在生物研究中注意到章魚有多個分散式大腦，卻只擁有一個意識，主意識的智力高於分別的分散式大腦。於是科學家利用死囚做試驗研究，把二個人的大腦的神經元透過工程學聯接起來，二個意識相互Pk，勝出的意識掌控了2個大腦，後來可以做到N個大腦接入了，從此誕生了一個可視宇宙中智力就高的東西，它很快就象成年人騙嬰兒手裡的糖一樣接管了地球上的一切文明。

駭客帝國最最最大的硬傷就是，墨菲斯在第一次向尼奧解釋人類是矩陣的什麼時，手裡拿的是一個金霸王電池，而不是一個CPU，C-P-U！！！。矩陣要是由N個人的大腦並行運算的，人大腦是矩陣主意識的物理載體，所以矩陣必須壓制每個人大腦

尼奧所謂的超能力，其實是一個反證，就如同另一部電影《盜夢空間》所顯現套中套，他們只是活在一個類似真實的虛擬世界內。

尼奧及錫城的人們，只不過是母體提升自我的工具吧！

個人觀點，在母體中尼歐確實是超能力，飛天，暫停子彈，彎曲勺子等等。但在現實中的其實只是控制機械烏賊，以及眼瞎後還能感知資料，其他並沒有特別的超能力。本質上回到現實後，尼歐是透過大腦直接連線母體獲得了高階許可權，讓機械烏賊暫停相當於遠端控制而已，眼瞎後的感知也只是資料經過大腦時的對映。並不是說尼歐回到的現實其實還是虛擬的，否則史密斯的叛亂以及先知的躲藏，被同化都很無聊，都是最表層的虛擬世界而已，有什麼好慌張的，還得和尼歐談判來消滅史密斯。