作為藥用沒有問題，因為在加工的過程中已經把各種病菌處理好了，吃就不同了，煮的過程中有時不能完全殺死病菌就會被感染，加上在交易過程中，特別是與其他野生動物共混，那樣病菌就會產生變異，也就容易感染給人。

我想，提問者模糊了一介概念，能入藥的蝙蝠不是蝙蝠的全部，這裡的全部:其一，所有的蝙蝠種類，其二:整隻蝙蝠的整體。

在中醫藥界，絕大多數都能入藥，無論動物，植物。植物的根，莖，葉，果實，(果肉，果核，果皮借可入藥) ，動物的筋，骨，皮毛…可入藥。

對於能入藥的動植物，古代的人們要進行許多工序的加工製作，不是隨隨便便就入藥，炮，泡，曬，蒸，煮，晾，烘，焙，烤。就是為了去其糟粕，取其精華。

必須承認，是藥三分毒，在使用上，就必須有一個“量”的問題，"過”尤不及，欲速則不達，矯枉過正，等說的就是這個麼意思。

即便是食藥同源的植物，經過一番加工烹飪，成為一道道美味佳餚，但食之過量，也會給人身體造成一定的傷害。

即便某些入藥的部分或全部，明明有毒，卻扁扁要入藥，正是古人利用:其特性以“毒"攻"毒“。神農嘗百草惠及炎黃子孫，李時珍嘗百草，留下《本草綱目》。

今天的人們，你們的祖先受惠於中醫中藥，反中醫反中藥的人們，敢拍著胸脯說，你的祖先從未受惠於中醫藥。天地良心，人在做，天在看。

今天的人們，當西醫藥傳入古代的中華，使人們患病後較能速的治癒。反對西醫藥的人們也不能闓顧事實說瞎話吧。

在對待中西藥上，應有的態度是不偏不倚，各取所長。洋為中用，古為今用，以科學的態度，一分為二的看待中西醫。應當允許百花齊放，百家爭鳴。

言歸正傳。不是所有的蝙蝠都能入藥，不是任意方法都能治病。

在上世紀80年代出版的書籍當中，《常見藥用動物 養殖·採集與加工》指出蝙蝠以糞入藥，中醫藥上稱之為夜明砂。其形狀為長橢圓形顆粒，兩端微尖長5一7毫米，直經約2毫米;表面粗糙，棕褐色或灰棕色，無臭味。性寒，味微苦而辛。據分析，含尿素、尿酸、膽甾醇及少量維生素A等。有活血消積、清熱明目的功能。用於治療夜盲症、白內障、角膜雲翳等症。

九十年代以前有老中醫將人的糞便用於治療癌症，慢性結腸炎，西醫都說是迷信，而現在浙江與江蘇的省立三甲醫院都將他作為了科研來進行臨床試驗，結果臨床療效非常喜人，但目前還不能大批次做成商品製劑，所以普通百姓不宜將嚴謹的專業問題隨意去評頭論足！就連常用抗生素就是來源於各類細菌，只是普通人看倒糞便的噁心就否定一切，尤其是一些紙上談兵的理論大伽。

不論題主所提的問題是對還是錯，至少題主沒有盲目的相信一些說法。蝙蝠背鍋的事在世界範圍內均有發生，以後也依然會有，野生動物也如此。個人感覺應是野生動物越來越受保護的原因吧！無需擔責。

‘科學’是受時間限制的，隨著科技的發展，我們現在認為科學的東西以後我們的後代也會因淘汰而認為不科學。

中醫會被淘汰嗎？這種治病救人的方法在世界各地均有應用，只是叫法不同，治療效果不同，治療所需時間不同等，還有許多的未知因素沒有被研究出來，所以中醫會是人類漫長的社會活動所研究的‘科學’才對。

若一定要讓野生動物或蝙蝠背鍋，又不承認中醫的話，人類早在住山洞的時候就該滅絕了，因為那時蝙蝠也住山洞，人類吃的肉類都是野生的，生病不用中藥治療，想想都可怕！哦！不對，恐怕連現在想的機會都沒有了，還在這裡大談特談所謂的‘科學’。

值得提醒的是：那些隨意否定中醫方法的人是近代從石頭縫裡蹦出來的還是由近代‘科學’造出來的嗎？

古人在與疾病抗爭的過程中，研究過各種各樣的天然藥物，並且對其性味、歸經、加工、配伍等作了認真細緻的記錄，這些中醫中藥典籍是古人傳承積澱的精華，是人類文明的珍貴財富。值得珍惜儲存。現實生活中，因為多種原因，有些中藥已經不在用了，被更簡便易得更乾淨更有效的中藥取代。就如蝙蝠，古人肯定做過應用研究，曾用於治療某些疾病，但療效一般，且醜陋噁心，又是殺生，就慢慢退出藥材市場，被夜明砂取代了。夜明砂即蝙蝠糞便，與蝙蝠同效，且易得，又不殺生，加工處理後沒有任何毒性。所以，一定要人性化看待中醫中藥，不要戴有色眼鏡，不要偏執，不要雞蛋裡挑骨頭。