超級計算機的數量沒有普通pc那麼多，統一制式的作業系統必然沒有多少利潤空間。

超級計算機的架構不同於普通伺服器，叢集等。他可以採用英特爾的cpu，也可以用中國產的龍芯，採用不同的處理器，就要用不同的指令集。windows是封閉原始碼的，你要求微軟為他單獨編譯一套作業系統，既成本高昂，也不具有現實性。

超級伺服器的效能，對於最佳化特別重要。要想壓榨出最強的效能，必然要放棄很多通用指令，使得系統只可以在這臺機器上執行，挪窩就不行。

linux得意於開源的特性，其實更確切的說是自由的權利。你可以獲得原始碼，修改它，最佳化它，編譯它，讓它完全適應你的機器。自由的權利很重要，在軟體圈混，被人指指點點總是不好的。

最後，現實卻不是完全這樣。超級計算機一般都是屬於保密資產，開放原始碼終究是不好的。實際在超級計算機執行的linux系統，會對一些程式碼做替代，以避免開源。

　90%以上(準確地說是94.2%)的超級計算機使用Linux作為自己的作業系統。在本文中，我們將試圖探討Linux之所以成為超級計算機作業系統最佳選擇的優點和特性。 　　的確，沒有誰比負責部署和維護超級計算機的團隊更有資格闡明Linux作為超級計算機作業系統所具有的能力了。在我們探討Linux的重要功能特性之前，不妨先看一下超級計算機領域的重要人士對Linux有什麼樣的評價;他們被問及選擇Linux作為超級計算機作業系統時又會給出什麼樣的理由。 　　早在2000年，新墨西哥大學建立了一臺採用紅帽Linux的虛擬超級計算機Los Lobos，當時的初始投入是150萬美元。Frank Gilfeather博士當時被任命為新墨西哥大學的高效能計算執行董事。Gilfeather說：“我們有幾個客戶，將得益於基於Linux叢集的高效能計算。我們認為，在將來，這對電子商務來說同樣會很重要——因為越來越多的客戶在部署中介軟體和訊息佇列系統，它們需要你在Linux叢集中看到的那種強大功能：這表明Linux作業系統提供了高效能。”他進一步說：“大型Linux超級叢集的出現歸因於像PC這些大眾化部件的急劇發展、Myrinet等高速商用現成技術(COTS)網路的發展以及開放軟體運動的迅猛普及……因而，相對傳統的超級計算機，就能夠以極其合理的成本建立起真正的超級計算機。” 　　Stephen Scott是橡樹嶺國家實驗室計算機學部門的一名研究科學家，也是Linux超級計算機的早期使用者/研究人員之一。他說：“科學界會喜歡Linux，因為它非常酷似標準的Unix。”Scott補充說：“大多數高效能環境是Unix，但是所有免費的GNU工具都使得Linux部署起來極其容易、極其省錢。” 　　瞭解了專家們發表的一番觀點後，不妨深入介紹讓Linux成為超級計算機作業系統最佳選擇的功能特性： 　　1. Linux的模組化 　　門外漢可能認為典型的Linux是由許多很小的基本元件即模組構成的。每個模組執行不同的專門功能。這些基本元件協同工作，讓作業系統得以順暢執行。Linux的這種模組化特性方便了所有人，無論他們是普通的Linux使用者，還是超級計算機管理員——可以改動作業系統，以適合自己的需求。其他的作業系統都無法提供這種程度的定製性，尤其是Windows。因而，可以對Linux進行改動，以便用在超級計算機上，實現專門的目的，尤其是增強效能或提高能效等。如今，大多數超級計算機都採用了經過改動的Linux核心。 　　2. Linux核心的通用性 　　Linux核心具有儘可能強的通用性。這意味著，只要編寫單一的原始碼，既可以在大型超級計算機上執行，也可以在小型裝置、甚至手持裝置上執行。無論是在大型系統上還是在小型系統上，如何使用Linux，這完全取決於使用者。也不需要為了可以在更大或更小的系統上執行而對核心進行根本性、重大的改變。通常來說，Linux核心既可以配置成2MB這麼小，也可以配置成1GB或1TB這麼大，不需要花很多的時間和很大的精力。 　　3. 可擴充套件性 　　按照定義，可擴充套件性是指伺服器適應更龐大負載的能力。可以直接把可擴充套件性看成是衡量效率和效能的一個尺度。系統必須具有極高的可擴充套件性，那樣新增新伺服器應該不費吹灰之力。Linux具有極高的可擴充套件性，因為它能夠相當輕鬆地適應新的、更大的負載。這就是為什麼你能發現Linux在超級計算機上執行，而安卓(使用Linux核心)在手機、冰箱、甚至微波爐上執行! 　　4. 開源性 　　Linux是完全開源的自由軟體，一整套原始碼完全開放。這意味著，超級計算機管理員能夠對這款作業系統隨意進行定製。此外，萬一超級計算機上出現效能故障或安全漏洞等，管理員可以隨時改動程式碼，以獲得最大的效能和最高的安全性(或實現其他任何目的)，而不是等專有作業系統公司釋出安全補丁。 　　超級計算機力求實現效能最大化。通常，超級計算機被分配的任務要求以非常高的速度來處理計算任務。相比之下，Windows有眾多沒有必要的無關程序，只會拖累超級計算機的效能。不過，由於Windows是專有的作業系統，無法改動程式碼以消除沒有必要的程序。至於Linux，完全可以改動程式碼，消除無必要的程序，因而為計算機提升效能。 　　5. 社群支援 　　作為開源作業系統，Linux得到了社群的大力支援，這是其他任何一款作業系統所無法比擬的。 　　6. 成本低 　　說到像超級計算機這樣的龐大裝置，成本可能是個大問題。在超級計算機上部署Linux具有成本效益，因為Linux完全不用支付特許使用費。 　　使用Linux作為作業系統的其他理由是，Linux的網路支援功能很好。新增或刪除任何嘗試性的網路裝置都比較容易。不需要系統重啟!Linux是一款穩定而可靠的作業系統，可以在成本高昂的大型伺服器和計算機上執行，沒必要擔心太多的問題。最後，Linux來得更安全。