黑木耳是中國傳統的出口商品，目前已經實現規模化、袋料化栽培。但由於粗放的栽培方式、缺乏科學、配套的防治病蟲害的措施，使得病蟲害種類日趨增加，蔓延加快，危害增大，已成為黑木耳高產、穩產的重要限制因素；所以，有效地控制黑木耳病、蟲及雜菌的危害是實現黑木耳高產、穩產、優質的重要一環。

食用菌病、蟲及雜菌的防治一定要貫徹“預防為主、綜合防治”的方針。要特別強調環境衛生和改進栽培技術措施的作用，選擇生長勢好、抗逆性強的品種，控制病、蟲及雜菌的發生。如果確需化學藥劑作輔助治療，則要選用高效、低毒、低殘留的藥劑，並做到適時、適量，合理使用。

（1）木黴

性狀與為害：菌絲蔓延生長，菌落邊緣不齊，初生為白色；菌絲成絮狀或線球狀，成熟後分枝頂端的孢子梗上生有成團的分生孢子，產孢子後，菌落變成銅綠色。喜陰暗潮溼通風不良的環境，特別是在高溫高溼情況下生長蔓延最快。黑木耳菌絲體受害後即停止生長，以後逐漸潰爛。子實體被侵染後，很快就會被木黴的菌絲及分生孢子圍成粘溼的綠色孢子團。

防治方法：①滅菌時培養料要蒸透，杜絕夾生料；②接種時嚴格按無菌操作，汙染重的耳房用50%多菌靈1000倍液噴霧；③發生初期，用3.5%碳酸液或200倍液50%多菌靈區域性注射，然後放在20℃以下陰涼通風處抑制擴散；④汙染嚴重的菌袋搬出室外深埋或燒燬。

（2）鏈孢黴

性狀與為害：鏈孢黴即紅色麵包黴，菌落初為白色粉粒狀，後為絨毛狀，菌絲透明，生有成串的鏈狀孢子，菌落為鮮豔的橘黃色。培養基中溫度高溼度大時蔓延快。能隨風飄揚，蔓延極快，危害損失嚴重。

（3）毛黴

性狀與為害：毛黴又稱黑色麵包黴，屬好溼性真菌，菌絲細長，無隔，生長茂盛，孢子無色，球形或橢圓形。

（4）麴黴

性狀與為害：麴黴的種類繁多，常見的有黑麴黴、黃麴黴。黑麴黴分生孢子黑色，菌落黑色，黃麴黴菌落淺黃色到綠色。麴黴的繁殖力不是很旺盛，但菌種受了汙染，常會影響產量。

（5）青黴

性狀與為害：青黴菌絲前期多為白色，後期轉為綠藍色、灰綠色、黃色等。青黴喜溫喜溼。在25～30℃溫度下，若通風不暢、溼度大，能迅速蔓延生長，分泌毒素，導致菌絲死亡。

（6）黑疔（環紋炭團）

這是為害耳木的一種競爭性雜菌。為黑褐色顆粒狀，在高溫潮溼廕庇的地方最易發生，多時連成一片，分泌的炭質硬，使樹皮下的形成層變成黑色，吸不進水分。