題主的提問，範圍太大了。那麼我也分類做個簡略的回答，具體題主還可以繼續搜尋相關內容。但如題主所要的幹掉米國等的無厘頭穿越，貌似還沒有觸及。相信以後會有的。

一 動漫

1『君の名は。』（2016年）【動漫】

2『虹色ほたる』【動漫】

3『映畫クレヨンしんちゃん 超時空！嵐を呼ぶオラの花嫁』（2010）【動漫】

4『打ち上げ花火、下から見るか？橫から見るか？』（2017）【動漫】

5『未來のミライ』（2018）【動漫】

6 『淡海乃海』

二 電影

1『時をかける少女（2010）』【電影】

1983年版

2008年動漫版

2『東京少女』（2008）【電影】

3『バブルへGO！！タイムマシンはドラム式』（2006）【電影】

4『テルマエ・ロマエ』（2012）【電影】

5『僕だけがいない街』（2016）【電影】

三 文學

1 『ターン』北村薫

2 『名前探しの放課後』辻村深月

3 『時生』東野圭吾

4 『通りゃんせ』宇江佐真理

5 『イマジン』清水義範

以上都是比較有代表性的作品。但好像無法滿足你的腦洞。僅供參考。

非常多，日本輕小說有很多穿越，但是日本出書也要稽核，有很多限制，比如不能惡意涉政…沒錯…日本也有這種制度…所以都是偏輕鬆向，而且架構虛構居多。