介於基本農田是不允許建任何房屋的，這是一條鐵的規定，要建的話也要經過審批才能建造，在你這種情況，別人在你的農田裡建房，更是錯上加錯，在你不同意的情況下首先要求他自行拆除，揮復農田基本原貌！如果在協商無果的條件下，可經過村，大隊，調解。調解無果可要求鄉鎮府對其強制拆除。還有一種情況是在偏遠山區，在鄰居外出打工多年未歸，在別人土地農田裡搭建養殖棚或養殖屋，政府在不知情的條件下，對養殖業還有一定扶持，這種情況可根據實際協商以出租田地的方式收取租金，這也是解決農田被人佔用的辦法。個人看法供參考謝謝！

無奇不有，還有這事啊？也許你常年在外才發生這類問題吧！建議：一是自己解決，找對方亮明觀點，讓侵佔你土地的自行拆除；二是找村委會或土管部門解決，可以把你承包地的產權手續提供給村委會或職能部門，由村委會或土管職能單位負責讓對方拆除即可；三是起訴至法院辦理，依法拆除。在這裡還有一個關鍵因素，你的農田是什麼性質，是一般農田，還是基本農田，如果是基本農田，就要迅速拆除，恢復土地原貌，中國法律規定非法佔用基本農田5畝以上的非法建築，屬於犯罪行為，處5年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處罰金。一般農田雖然未有這麼嚴格但也必須由市、縣人民政府審批後才能建設，如果沒有報批也屬於違規建設專案。對已經形成的違規建設專案，除了依法拆除外，還必須根據影響大小追究鄉鎮、村屬地監管責任和主管部門的日常監管不力責任。追究部門的失職瀆職責任你可以向當地紀委監委反映。