1、三文魚和大馬哈魚的科屬不同

三文魚為動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、輻鰭魚綱、新鰭亞綱、鮭形目、鮭科、鮭屬與鱒屬溯河洄游性魚類。

大馬哈魚為動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、硬骨魚綱、輻鰭亞綱、鮭形目、鮭科、太平洋鮭屬（大馬哈魚屬）冷水性溯河產卵洄游魚類。

2、三文魚和大馬哈魚的產地不同

三文魚別稱北鱒魚、大馬哈魚、羅鍋魚、馬哈魚、麻糕魚等，主要分佈在太平洋北部及歐洲、亞洲、美洲的北部地區，主要種類有挪威三文魚、美國三文魚、大馬哈魚等。

大馬哈魚別名北鱒魚、大發哈魚、羅鍋魚、馬哈魚、麻糕魚、大麻哈魚等，分佈於太平洋北部和北冰洋中，主要有大馬哈魚、駝背大馬哈魚、孟蘇大馬哈魚、銀大馬哈魚等種類。

3、三文魚和大馬哈魚的形態不同

三文魚的體型側扁，背部隆起，齒尖銳，鱗片細小，銀灰色，產卵期有橙色條紋，肉質緊密鮮美，肉色為粉紅色並具有彈性，鱗小刺少。

大馬哈魚一般體長60釐米左右而側扁，略似紡錘形，頭後至背鰭基部前漸次隆起，背鰭起點是身體的最高點，從此向尾部漸低彎，頭側扁，吻端突出，微彎，口裂大，形似鳥喙，上下頜各有一列利齒，眼小，鱗也細小，作覆瓦狀排列，脂鰭小，位置很後，尾鰭深叉形。