大家好，我不是權威，我是漫步科研路。
這裡題主說的基因樹應該是指基因進化樹，這是判定相似基因之間的進化關係的一種演算法。我是學植物科學的，這種進化樹經常用到。我大致講講，不知道大家能不能聽得懂。
比如很多個基因，我們不知道他們之間的關係是什麼樣的，那麼我們就可以去把他們蛋白序列兩兩進行比對，最後根據計算機的演算法得出一定的相似度值，然後根據這些相似度值就會生成一個跟樹一樣的圖。這種圖怎麼看呢？就是看分支，如果兩個基因在同一個小分支上那麼他們之前的同源性就更高，他們的親緣關係越近。反之就越遠，關係就越小。
這種樹判斷親緣關係和同源性有什麼用呢？在基因功能研究中就太管用了。比如你知道了A基因的功能，那麼後來你透過進化樹分析，發現有個基因B跟A基因相似度很高，那麼我們就可以推測B基因的功能很有可能就跟A基因是一樣的。那麼我們後面分析B基因的表型性狀的時候，就可以直接參考A基因的研究結果。
還有一個很重要的作用就是分析某種未知基因的來源。就拿新冠病毒來舉例子，為什麼科學界發現這個病毒，馬上就去測序，知道它的基因組。就是想知道這個病毒的來源。怎麼知道呢？冠狀病毒很多種，那麼我們就可以把新發現的新冠病毒跟已知的所有冠狀病毒都比對一下，生成一個進化樹，看看哪種病毒跟新冠病毒最相似。後來科學家不就發現蝙蝠體內和穿山甲體內中的某兩種病毒跟新冠病毒最相似，由此科學家就推測這個新冠病毒是來自於蝙蝠和穿山甲。因為他們之間的相似性超過了90%。雖然不能完全斷定就是來自於這兩種動物，但是至少可以提供了一定的線索，然後就去找其他線索，比如找更多的0號病人，分離出他們體內最原始的新冠病毒，然後測序，再比對。
大家好，我不是權威，我是漫步科研路。
這裡題主說的基因樹應該是指基因進化樹，這是判定相似基因之間的進化關係的一種演算法。我是學植物科學的，這種進化樹經常用到。我大致講講，不知道大家能不能聽得懂。
比如很多個基因，我們不知道他們之間的關係是什麼樣的，那麼我們就可以去把他們蛋白序列兩兩進行比對，最後根據計算機的演算法得出一定的相似度值，然後根據這些相似度值就會生成一個跟樹一樣的圖。這種圖怎麼看呢？就是看分支，如果兩個基因在同一個小分支上那麼他們之前的同源性就更高，他們的親緣關係越近。反之就越遠，關係就越小。
這種樹判斷親緣關係和同源性有什麼用呢？在基因功能研究中就太管用了。比如你知道了A基因的功能，那麼後來你透過進化樹分析，發現有個基因B跟A基因相似度很高，那麼我們就可以推測B基因的功能很有可能就跟A基因是一樣的。那麼我們後面分析B基因的表型性狀的時候，就可以直接參考A基因的研究結果。
還有一個很重要的作用就是分析某種未知基因的來源。就拿新冠病毒來舉例子，為什麼科學界發現這個病毒，馬上就去測序，知道它的基因組。就是想知道這個病毒的來源。怎麼知道呢？冠狀病毒很多種，那麼我們就可以把新發現的新冠病毒跟已知的所有冠狀病毒都比對一下，生成一個進化樹，看看哪種病毒跟新冠病毒最相似。後來科學家不就發現蝙蝠體內和穿山甲體內中的某兩種病毒跟新冠病毒最相似，由此科學家就推測這個新冠病毒是來自於蝙蝠和穿山甲。因為他們之間的相似性超過了90%。雖然不能完全斷定就是來自於這兩種動物，但是至少可以提供了一定的線索，然後就去找其他線索，比如找更多的0號病人，分離出他們體內最原始的新冠病毒，然後測序，再比對。