戰爭勝利後，朱元璋並沒有對蒙古人趕盡殺絕，朱元璋做出了一些措施。那就是“同化”。具體而言，分三個政策執行：第一，蒙古人必須改姓漢姓，使用漢族文字，學習說漢語；第二，蒙古人不可再穿蒙古服飾，必須穿漢服；第三，蒙古女人不可與蒙古男人通婚，必須為漢人生孩子，否則貶為奴隸，甚至處死。蒙古族的女人竟然要和漢族人結婚，就像是背叛了自己的種族一樣。朱元璋的這種方法，太殘忍了

蒙古族跟漢族因為元朝的關係已經不共戴天了，朱元璋釋出了這樣的規定讓漢人一頭霧水。但是長遠來看這個規定是非常狠的。漢族女子是不可能嫁給蒙古族男子的，如果蒙古族女子都不嫁給漢族男人的話，那他們這個族人就沒有辦法在延續下去的，用不了多長時間就會滅族了。如果漢族人娶了蒙古族的女子，兩人生活之後，慢慢的蒙古族女子也就被同化了，用不了多久蒙古族整個民族就被漢族人民給同化了

朱元璋就是要透過通婚的方式逐漸淡化蒙古族人的血統，把他們同化為自己人，有了共同的文化認識之後，他們就不會去造反了。不得不說，朱元璋這招太機智了。

元朝滅亡後，在明朝境內還留有二十來萬元朝遺民，因常年戰爭，遺留下的女子偏多，一向心狠手辣的朱元璋這回並沒有向這些遺民們伸屠刀，而是用一系列的政策去同化他們。

一:讓蒙古人不允許穿自己民族的特色服裝，必須要學會穿漢人的服裝，並且要學會漢人的語言和文字，學會漢語的風俗文化。

二:蒙古族的人不允許內部通婚，蒙古的人和蒙古的人不能夠結婚，只能和漢人結婚。朱元璋下令讓所有的蒙古女人只能夠嫁給漢人，不允許嫁給蒙古人。如果那些蒙古女人嫁給了蒙古的男人，她們就會被朱元璋下令逮捕。

不得不說朱元璋這一手玩的非常漂亮，不但穩住了蒙古人害怕被屠殺而起造反的心，還將蒙古族同化後徹底的斷絕了大明隱患，著實是高！

元朝滅亡後，朱元璋把俘虜的蒙古族人，包括大量的婦女，既沒有殺害，也沒有驅逐，而是強制他們和漢族通婚，融合於中華民族之中。

元朝建立之後，大量蒙古人南下定居，經過一百餘年的繁衍，蒙古人、色目人，就有一百多萬。

徐達北伐時，元順帝放棄北京，逃回了草原。只帶走了大約4萬戶，按一戶4-5人計算，也不過20萬人，其餘的幾乎全留下來了。而且留下的人中，婦女居多，因為青壯年蒙古人都被徵發入伍，要麼戰死，要麼被俘，要麼逃走了。

對於這100多萬蒙古人，朱元璋該如何處理？

朱元璋主要採取了下列措施：

一、只要歸降，一視同仁

朱元璋宣告，蒙古、色目人，只要願為臣民者，“與中夏之人撫養無異”。

朱元璋是這樣說的， 也是這樣做的。

朱元璋的兒子秦王朱樉，娶得正妃就是蒙古女子，而且就是大名鼎鼎的王保保的妹妹。

王保保（也就是擴廓帖木兒）在明初很多年，一直帶領北元蒙軍，和朱元璋的部隊打仗。朱元璋不僅不恨他，還稱讚王保保是天下奇男子，一心想招降他。

朱元璋不僅不殺害王保保的妹妹，也沒有歧視他，反而讓她成為自己兒子的正妃，請注意，是正妃，不是小妾。

二、漢化政策

禁胡語、胡服、胡姓名，蒙古色目紛紛改名換姓，幾代人之後，就與漢人無異了。

朱元璋還詔令蒙古人色目人衣冠如唐，與華人無異。

三、禁止蒙古、色目人內部通婚，就是蒙古色目女性要嫁給漢人，蒙古、色目男人要娶漢女。

朱元璋下令：

朱元璋的這一條政策看起來不太人道，實際上最人道。

大家都知道西晉末年，匈奴、鮮卑等少數民族大量來到中原，聚集在一起，終於爆發了五胡亂華的悲劇，黃河以北的漢人，遭到了滅絕性的殺戮，漢族女人淪為“兩腳羊”，淪為胡人的食物。

朱元璋站在歷史的高度，以博大的胸襟，接納了大量蒙古族的遺民。

又透過漢化政策，蒙漢強制通婚的政策，比較順利的實現了北方民族的大融合。

功在當時，利在千秋。

元朝末代皇帝元順帝妥歡帖睦爾既沒有戰死，也沒有自殺，而是率領著王族和所剩的軍隊撤退到了自己祖先曾經興起的故地——蒙古高原，在中國完成了一次外來政權全身而退的“奇蹟”。

1368年，享國運不足百年的元朝被朱元璋領導的起義推翻了，與遼、金、西夏等少數民族政權不同，末代皇帝元順帝妥歡帖睦爾既沒有戰死，也沒有自殺，而是率領著王族和所剩的軍隊撤退到了自己祖先曾經興起的故地——蒙古高原，在中國完成了一次外來政權全身而退的“奇蹟”。這得歸功於從成吉思汗開始的近似於瘋狂的擴張，使得蒙古帝國幅員遼闊，汗國、部落林立，而元朝的版圖只算蒙古帝國的一部分，元朝的皇帝又是蒙古帝國的大汗，對於蒙古各大汗國和部落享有宗主權。元朝的滅亡，只是使蒙古帝國失去了中國的領土，而蒙古帝國依然存在。

殘元政權的滅亡

1368年，享國運不足百年的元朝被朱元璋領導的起義推翻了，與遼、金、西夏等少數民族政權不同，末代皇帝元順帝妥歡帖睦爾既沒有戰死，也沒有自殺，而是率領著王族和所剩的軍隊撤退到了自己祖先曾經興起的故地——蒙古高原，在中國完成了一次外來政權全身而退的“奇蹟”。這得歸功於從成吉思汗開始的近似於瘋狂的擴張，使得蒙古帝國幅員遼闊，汗國、部落林立，而元朝的版圖只算蒙古帝國的一部分，元朝的皇帝又是蒙古帝國的大汗，對於蒙古各大汗國和部落享有宗主權。元朝的滅亡，只是使蒙古帝國失去了中國的領土，而蒙古帝國依然存在。

元順帝是元朝皇帝中少有的接觸漢文化較深的一個，大都陷落倉皇北歸的打擊，對於他來說是極大的，雖然依然還是蒙古各部的大汗，但也不能排解他“去國懷鄉”的憂愁，尤其是明朝軍隊對於他的繼續打擊又接連不斷，更使他惶惶不可終日。終於，1370年5月23日，他懷著悲憤和鬱悶，在沙拉木倫河畔的應昌去世。

元順帝的兒子愛猷識裡達臘獲悉父親去世的訊息後，便在哈拉和林繼位，他將殘元政權又維持了八年，並厲兵秣馬盼望著有朝一日重登中國皇位。然而，他非但沒有機會實現這一願望，還面臨著深入到蒙古地區的明朝軍隊的攻擊。1372年，明朝大將徐達率軍攻向哈拉和林，這是蒙古黃金家族的大本營，是權力和榮耀的象徵，一旦被明軍攻破，蒙古帝國將徹底在世界上消失，因此，蒙古人的抵抗十分激烈，但是，被譽為“萬里長城”的徐達一路上勢如破竹，愛猷識裡達臘幾乎到了絕望地邊緣。所幸，明朝的大軍由於戰線過長，後援不繼，受阻於土拉河畔。

1378年，愛猷識裡達臘懷著滿腔遺憾去世，其子脫古思帖木兒繼位，這位第三任殘元皇帝所能控制的領土已經縮小到蒙古帝國最初興起時的規模，恢復祖上的榮光更顯得毫無可能了。

1388年，一支10萬人的明朝軍隊在大將藍玉的率領下在合勒卡河和克魯倫河之間、貝爾湖南岸大敗脫古思的軍隊，殘元諸王、平章以下官員三千多人及軍士七萬餘人被俘，脫木思帖木兒逃走後被其部將縊殺。

這次的失敗使黃金家族——忽必烈家族的殘元政權喪失了在蒙古人中至高無上的地位，以至於大多數蒙古部落宣佈脫離它而自立。1399年，分佈在葉尼塞河上游沿岸的乞兒吉斯部首領貴力赤，否認了最後一任殘元皇帝額勒伯克的宗主權，於1399年將其打敗並殺死，取得了統治各部的霸權。至此，苟延殘喘了29年的殘元政權滅亡了，合法的蒙古帝國大汗不復存在了，蒙古各部又回到了爭奪蒙古帝國大汗寶座的紛爭當中。

群雄紛起爭汗位

殘元的滅亡，使明朝失去了政治上的敵人，蒙古已經成為了“邊患”，而不再是前一王朝殘餘勢力。因此，永樂皇帝對於貴力赤表示了極大的友好，承認了他對於蒙古各部的宗主權。

但是，貴力赤也並沒有保持汗位有多久，便在1400年被阿蘇特部首領阿魯臺和衛拉特部首領馬哈木的聯軍打敗。阿蘇特部是蒙古化了的伊朗人，起源於高加索，因蒙古西征而進入中國，元朝軍隊中有一支由他們組成的軍團。而衛拉特部是森林蒙古人中的一個強大的部落，在成吉思汗時代被稱為“林木中百姓”，定居在貝加爾湖西岸。

阿魯臺和馬哈木都不想成為蒙古帝國的大汗，他們最為希望的還是自己的部族獨立於蒙古人之外而獲得承認，因此，在打敗貴力赤後，便嚮明朝效忠，表示自己不同於其他爭奪蒙古帝國汗位的部族。這樣的臣服是明朝求之不得的，給了他們極大的支援的支援。依靠這種支援，衛拉特部將其霸權擴張到從貝加爾湖西岸到額爾齊斯河上游的整個西蒙古地區。

然而，阿蘇特部和衛拉特部對於蒙古中部和東部控制都沒能長久，貴力赤之子額色庫重新崛起，要與阿魯臺和馬哈木爭奪大汗寶座，雙方進行了十幾年的戰爭，直到額色庫於1425年病死。

在額色庫不停的與阿魯臺和馬哈木爭奪最高宗主權的同時，在1403年，殘元末代皇帝額勒伯克之子本雅失裡復辟了自己的汗位，宣佈自己為蒙古帝國的大汗。作為黃金家族的後代，本雅失裡無疑要比阿蘇特部和衛拉特部具有號召力，不久，包括阿魯臺在內的各蒙古部落聚集在這位正統代表者一邊。而好不容易盼到忽必烈家族衰亡的明朝，對這位新一任蒙古大汗的敵視是不言而喻的，永樂皇帝下旨要本雅失裡作出臣屬的明確表態。但希圖重現祖上功業的本雅失裡怎麼會向推翻自己家族在中國皇位的朱氏家族表示臣服呢？於是，永樂皇帝親自率軍進入蒙古，直抵成吉思汗故地——鄂嫩河上游平原，於1410－1411年擊潰了本雅失裡和阿魯臺的軍隊。這次失敗對本雅失裡來說是致命的，因為這使他喪失了作為大汗的權威。1412年，衛拉特部首領馬哈木乘機將他擊敗，奪取了汗位。

在此之前，馬哈木一直與明朝永樂皇帝保持著友好關係，但這時，他已經真正成為蒙古帝國的大汗了。於是毫不猶豫地與明朝皇帝斷交。這引得永樂皇帝再次親征蒙古，雖然馬哈木的抵抗使明朝軍隊遭到嚴重損失，但為了儲存實力，他率軍撤退到土拉河以西休養生息。馬哈木的威信由於這次入侵暫時受損，因為他也未能阻止明朝軍隊進入蒙古草原。

哈斯木逃走後，大汗寶座又懸空了下來，這時，居住在興安嶺以東、滿洲邊境的嫩江附近的科爾沁部首領阿臺在1425年率部眾佔領了蒙古中東部地區。那個見風使舵的阿蘇特部首領阿魯臺，這回又支援阿臺殺死了本雅失裡，擁立阿臺為蒙古帝國大汗。科爾沁人是成吉思汗弟弟哈撒兒的後裔，也屬於黃金家族。雖然永樂皇帝對於衛拉特的背叛不能容忍，但為了消滅在蒙古人中具有崇高威望的黃金家族，又開始支援衛拉特部。自然，對於這支援，衛拉特部也是欣然接受的。

黃金家族的復辟

在衛拉特人實力削弱的時候，成吉思汗後裔們並未立即組織反攻，因為他們正在家族戰爭中互相殘殺。

1467年，成吉思汗的第27代繼承人滿都古勒大汗在討伐他的侄孫和繼承人博勒呼濟農的一次戰爭中去世。

而博勒呼濟農在他能夠稱汗之前的1470年也被暗殺。一度人丁興旺的黃金家族中，現在僅剩下一個5歲的男孩、博勒呼濟農之子達延。

達延的命運及其不幸，家族的長輩都在內訌中死去，小小的孩子孤苦無依，連他的母親都拋下他改嫁了，這簡直比成吉思汗年幼時的遭遇還要悲涼。所幸，滿都古勒汗的年輕遺孀滿都海賽音可敦把他置於自己的保護之下。滿都海賽音可敦是一個了不起的女人，她不但撫養了達延，還在1470年宣佈他為大汗。最為難得的是，滿都海賽音可教作為女人率領軍隊打敗了衛拉特人，將他們徹底趕出了蒙古中東部地區。為達延汗日後的統治奠定了基礎。

達延汗是蒙古帝國統治時間最長的大汗，從1470年到1543年整整73年。在1481年親政之後，達延汗鎮壓了右翼土默特人、兀良哈人的叛亂。並從1497年到1505年間，他對從遼東到甘肅的明朝邊境地區進行了一系列卓有成效的攻擊，使得明朝無法與衛拉特人聯絡。

1543年達延汗去世之後，他的孫子博迪繼承了汗位。雖然廣大的領土被達延汗的眾多子孫瓜分，但從1544年到1634年蒙古帝國的汗位一直穩固的在達延汗的長支後裔察哈爾部中傳承，歷經博迪汗（1544－1548年）、庫登汗（1548－1557年）、圖們札薩克圖汗（1557－1593年）、徹辰汗（1593－1604年）和林丹汗（1604－1634年）。

蒙古帝國的滅亡

雖然達延汗的長期統治穩定了蒙古帝國汗位傳承，但並沒有克服蒙古民族的最大弱點——實行瓜分家族遺產的習慣法。當帝國的建立者死後，帝國便成了一種類似聯邦式的家族國家，國內的各級首領，都是兄弟或堂兄弟，他們雖然承認察哈爾部的最高權利，但處於相當的獨立狀態。

隨著時間的流逝，察哈爾部的汗位繼承者們逐漸失去了足以統治整個蒙古的力量，西方的衛拉特人和東方興起的通古斯人（滿人）都是他們可怕的敵人。但這個時候，衛拉特人正在對付哈薩克汗國、沙皇俄國以及內部的綽羅斯家族與和碩特家族的權力爭奪，因此，結束蒙古帝國歷史的，只能是通古斯人建立的後金帝國了。

1604年，林丹繼承汗位，接受黃教沙爾巴呼圖克圖的灌頂戒教，稱林丹庫圖克圖汗。林丹汗並不是一個昏庸無能的可汗，他早已看出後金帝國對於蒙古的野心，因此上從繼位始，便開始從新統一各部，自稱“統領四十萬眾蒙古國巴圖魯青吉斯汗”。1627年派兵收服右翼鄂爾多斯、喀喇沁、土默特等部，與喀爾喀部卻圖汗結為聯盟，聲威大振，所轄地域東起遼東，西至甘肅。但是，次年，朵顏兀良哈的蘇布臺、喀喇沁的達來臺吉、土默特和布石圖汗、額爾多斯的額仁沁濟農以及永謝布、阿蘇惕、阿巴嘎、喀爾喀等部聯合組成大軍十萬，在土默特的召城一戰中，消耗了林丹汗精銳兵力四萬餘人，這使得林丹汗的實力大為削弱，而他的敵人是綜合了蒙古人的彪悍和漢人的謀略的後金皇帝努爾哈赤和皇太極，這就註定只有勇猛而少計謀的他只能失敗。

努爾哈赤時，科爾沁部、扎魯特部便在聯姻之下歸附了後金。土默特、喀喇沁、兀良哈等部為了避免林丹汗的報復，也投奔了後金。1625年，林丹汗出兵嫩江，攻打科爾沁部。後金出兵援助科爾沁，林丹汗退走。皇太極即位後，把林丹汗做為主要的敵人。1628年，派遣貝勒阿濟格與老哈河上游受林丹汗統治的喀喇沁部會盟，共擊林丹汗。9月，皇太極親率大兵至綽洛郭爾，宴會察哈爾部控制下的敖漢、奈曼、喀爾喀、札魯特和喀喇沁等部領兵前來的諸首領。林丹汗空有大汗之名，但已經陷入了孤立，被迫退出西拉木倫河流域，至歸化城（今呼和浩特）固守。

1632年4月，皇太極再率大軍西進，多爾袞從徵。至西拉木倫河畔，會集蒙古諸部兵，共擊林丹汗。面對勢力遠勝自己的敵軍，林丹汗無奈自歸化城驅人畜十萬渡黃河西逃。但面對已經大勢已去的大汗，部眾十之七八在途中散去。林丹汗逃奔青海，兩年後在青海打草灘病死，他臨死前，也許會和明朝的末代皇帝崇禎一樣，哀嘆“朕不是亡國之君！”，他們都努力過了，但是他們的才能都無法使他們重現祖上的榮耀。明帝國和蒙古帝國爭鬥了兩百多年，誰也沒能消滅對方，最後，在相差不到10年時間內，先後被滿清所滅。

1635年，多爾袞與嶽託等領兵萬人渡河，招降林丹汗部眾於額哲，林丹汗的妻子和兒子歸降，交出可汗印信，整個漠南蒙古完全納入了後金帝國的版圖，蒙古帝國的汗位至此斷絕，而蒙古帝國，也永遠的消失了。

基本沒有，而是強制同化了。在哪裡生活的還在哪裡，但有一點那就是放棄蒙古人的特權，包括文字語言，安心做大明的百姓。

朱元璋可謂是中國古代創業最難的一位皇帝，其出身最底層的貧民，可謂是頭無片瓦，腳無立錐之地。而且在蒙古人的殘酷統治下，其父母，還有幾個兄弟姐妹先後被餓死，可謂是最恨統治者了。而在1368年，朱元璋逐鹿群雄，問鼎天下，稱帝建國。那麼其稱帝后又是怎麼對待蒙古人的呢？

很多人都說，朱元璋稱帝后，元朝蒙古人不都跟著元順帝跑了麼？其實沒有，當時元大都有40萬戶的蒙古人，而元順帝跑的時候太倉促，只帶走了4萬戶，而且加上其他地方留下來的蒙古人，估計總戶數在50萬左右。如果按照4人一個家庭的話，至少有160萬蒙古人留在了大明朝。

這也是元朝統治者，在中原統治上百年的成果。而對於這些人的處置，很多人建議跟當年蒙古滅南宋一樣——殺。因為元朝時這些人高高在上，為所欲為，做了很多傷天害理的事情，因此，理應受到處罰，而且當年蒙古人入主中原何止殺了千萬。

但是，朱元璋做了皇帝后，認為蒙古人那也是其子民，要以仁義為本，因此沒有下令殺。但是，如果讓蒙古人和色目人繼續做大肯定不行，因此，想了一招，那就是要同化他們，把他們都變成漢人，因此，下了三道命令。

一是，改姓，命令蒙古人全部改成漢族姓氏，用漢族的名字，不在允許他們用自己的。二是，改服裝，跟滿清入主中原，讓漢人改服飾一樣，朱元璋下令讓蒙古人只能穿漢服，不再穿蒙古民族服裝。第三，下令蒙古女人只能嫁給漢人，為漢人生孩子，否則就貶為奴隸，甚至直接處死。

這最狠的就是第三條，蒙古女人只能嫁給漢人，這種情況的後果是蒙古人直接就被血統轉化，達到快速同化的目的。其實很多人可能不太理解，朱元璋為何要這麼做？其實最為關鍵的一點，就是斷絕這些蒙古人和當時還在草原的北元的聯絡，因為，一旦這些人跟北元聯手，那麼大明江山那是很危險的。所以在不殺的情況下，只能徹底同化，變成漢人就放心了。

朱元璋在古代帝王中以心狠手辣是出了名的，他眼裡容不得沙子，也比較容易猜忌別人。元朝復辟後，但他並沒有下令對蒙古人進行大規模的屠殺，也沒有讓他們遭受殘酷的懲罰，但是蒙古人所遭受的心理破壞比死亡更痛苦。

元朝時，蒙古婦女不能嫁給漢人，她們羞於嫁給漢人，當時朱元璋想把蒙古人同化為漢人。 當時，朱元璋頒佈了以下規定:第一，他廢除了蒙古的收養婚姻制度，即父親死後，兒子繼承除生母以外的所有小母親，或者弟弟死後，弟弟繼承所有寡婦。漢朝認為這是亂倫，朱元璋禁止;第二，禁止蒙古人穿蒙古服裝，講蒙古語。將改為漢服和中文;第三，蒙古婦女不允許嫁給蒙古人，蒙古婦女只能嫁給漢族男子。任何違反規定的人都會受到懲罰，如果任何一個蒙古人不遵守規定，整個家族都會被送去當奴隸。

元代，蒙古族婦女十分重視血的問題，朱元璋的命令無疑是讓蒙古族婦女走向災難。但最後，蒙古婦女不得不接受朱元璋的命令。朱元璋告訴蒙古婦女嫁給漢人，這無疑是一個非常明智的決定。他們沒有殺害蒙古婦女，而是嫁給漢人，這對明朝也非常有利。這種方法直接從根本上消除了對漢朝的威脅。在那之後，就沒有這樣的威脅了。

朱元璋依靠這種“同化”效應，使蒙古人不得不背叛自己的民族，接受漢文化。可見他的本意是好的，但這種懲罰對蒙古人來說是非常殘酷的。