《虐殺原形》的主角Alex本身就不算一個好人，根本說不上“黑化”。他最初就是黑光病毒的高階研究人員，後來因為怕被滅口就帶著病毒樣本逃離紐約，中途被黑色守望在賓夕法尼亞車站截獲並被當場槍決。最後時刻，他不顧全城市民的安危，釋放了黑光病毒，導致自己被感染。後來他的屍體被病毒基因改造成了“原型”。實際上，這個時候，也就是遊戲正式開始的時候，我們操控的角色就已經不是Alex本人了，而是黑光病毒本身。

所以這個遊戲中主角其實一直就是BOSS，不存在“黑化”一說。

如果這裡說的“黑化成BOSS”指的是在《虐殺原形2》裡面，Alex正式加入了BOSS戰，那麼他黑化的原因從第一部結尾就能找到端倪。當時，Alex已經找回了記憶，並瞭解到了自己的真實身份，也就是黑光病毒。他開始意識到自己是一個超越人類，甚至一切生命的終極生物。他認為自己的命運就是同化一切生命，站上食物鏈的最頂端，終結生物多樣性帶來的混亂。

所以在第二部的故事開頭，他再次釋放了病毒。這一次他的目的很明確，從病毒感染者中優選出最強者去吸收眾多人類的記憶和基因，不斷進化，最後再把他們一起吸收，如此就可以整合出最強的生物。所以，在第二部結尾，主角James Heller雖然打敗了Alex，但最終他們融合成了一體，實際上是部分完成了Alex的計劃，他們都成為了一個更強大的黑光病毒的一部分。

綜上可以看出，整個《虐殺原形》系列都是在講黑光病毒如何進化的故事。站在我們人類的角度，這個故事可能永遠都不會有完美結局。如果要說主角“黑化”的時間點，那便是一開始就已經墮入了無邊的黑暗。