黃藥師之所以在五絕之中得名號“東邪”，就在於他性情古怪，行事三分正，七分邪，做事總是出人意表，讓人琢磨不透，在對待徒弟問題上更是表現的十分明顯。

《九陰真經》是黃裳所著的一部武學秘籍，一經流落江湖就引起眾多江湖豪傑爭奪。後來王重陽奪到手後透過華山論劍力壓其他四絕，獲得名正言順的保管權，但這部真經的魅力仍然不減，五絕中的西毒和東邪對此秘籍都深感興趣。

不同於歐陽鋒的簡單粗暴直接出手搶奪被破掉蛤蟆功，黃藥師是在重陽真人逝世後遇到了找地方藏經的周伯通，打賭讓他的夫人馮蘅獲得了《九陰真經》下卷的觀看權，靠著馮蘅過目不忘的特殊能力複製了《九陰真經》，手段更加高明。

後來黃藥師的大徒弟梅超風和二徒弟陳玄風相處良久，情愫暗生，但又擔心師父責怪，於是拿了黃藥師複製的《九陰真經》下捲逃出了桃花島。黃藥師愛遷怒於人的古怪脾氣發作，乾脆將剩下的徒弟全打折了腿，挑斷了腳筋逐出了桃花島。陸乘風等一幫徒弟全全被梅超風和陳玄風連累以至於一生悲劇。

梅超風和陳玄風修煉《九陰真經》不得其法，在江湖上闖出了“黑風雙煞”的名號，和江南七怪也因“飛天神龍”柯鎮邪的死而結下了樑子，後來在大漠相遇後，陳玄風死於的郭靖之手，梅超風被柯鎮惡的毒菱打中雙眼導致失明，而七怪中的張阿生也因此喪生。

在歸雲莊，梅超風遇到了陸乘風，二人正欲算清前帳，結果遇到被識破了面目的裘千丈胡謅黃藥師被全真七子圍攻而死，梅超風和陸乘風對黃藥師仍然存在極深的感情，為此失控落淚，欲為師父報仇。黃藥師看在眼中，暫時饒過了梅超風，但死罪可免，活罪難逃，黃藥師在梅超風身上下了附骨針，交等她辦三件事：一是找回梅超風失落的《九陰真經》，並將看了的人全除去；二是將被他逐出桃花島的其他徒弟全尋回來；三是偷學了九陰真經，必須將學到的武功廢掉。辦完這三件事後才會為她解了附骨針。

黃藥師冷然道：“超風，你作了大惡，也吃了大苦。剛才那裘老兒咒我死了，你總算還哭出了幾滴眼淚，還要替我報仇。瞧在這幾滴眼淚份上，讓你再活幾年罷。”

所以說梅超風不是沒受罰，只是未等她真受罰，在歐陽鋒以蛤蟆功偷襲黃藥師時，梅超風以身替黃藥師捱了一擊，重傷離世，臨終之前黃藥師原諒了她，許她重歸桃花島門牆。

至於陸乘風，被逐出桃花島後他來到了太湖邊上建了歸雲莊成家立業。出於對師父黃藥師的敬畏和尊敬，未得允許無法將桃花島武學傳授給兒子陸冠英，乾脆裝著不會武功，自號五湖廢人。他兒子陸冠英拜入仙霞派，成為枯木大師的弟子，後來成為太湖水匪的頭領，說行俠仗義倒也未必全是。

黃藥師出手試探後發現陸乘風果然未私自將桃花島武學傳授別人，大感欣慰，於是允許陸乘風傳授自己兒子武功，並將自己創出的旋風掃葉腿法傳授給陸乘風，練好之後當可恢復行走能力。

黃藥師又道：“你腿上的殘疾是治不好的了，下盤功夫也不能再練，不過照著我這功決去做，和常人一般慢慢行走卻是不難，唉，……”他早已自恨當年太過心急躁怒，重罰了四名無辜的弟子，近年來潛心創出這“旋風掃葉腿”的內功秘訣，便是想去傳給四名弟子，好讓他們能修習下盤的內功之後，得以回覆行走。只是他素來要強好勝，雖然內心後悔，口上卻不肯說，因此這套內功明明是全部新創，仍是用上一個全不相干的舊名，不肯稍露認錯補過之意；過了片刻，又道：“你把三個師弟都去找來，把這功訣傳給他們罷。”

黃藥師傲嬌的性格顯露出來，礙於身份，又要強好勝，自尊心極強，雖然深知自己早年對徒弟的舉動過分了，卻不肯認錯，只是用行動來想法補償。他後來將自己徒弟曲靈風的女兒傻姑接回桃花島，盡心傳授武功，讓傻姑成為能和李莫愁抗衡的高手，就是懺悔的具體表現。說不喜歡陸乘風並不準確。

所以說黃藥師的兩大徒弟中，梅超風壞事做絕，最終也被黃藥師懲罰了，只是未等黃藥師真正懲罰，梅超風就出於愧疚和敬仰之心代黃藥師承受了歐陽鋒一擊而斃命。而陸乘風也並未真正的行俠仗義，但黃藥師也拿出了真實的行動來補償包括陸乘風在內的諸多早年被他傷害過的徒弟們，說不喜歡陸乘風並不準確。