全真教成立為射鵰時期，輝煌於神鵰時期，可惜最終還是被武林其他門派取代，正式消失於倚天屠龍記中。全真教也徹底被華山派所取代，全真七子之一郝大通建立了華山派。

我看了下前面的回答，實際都不沾邊，他們都以為是金庸故意把全真教遺忘了，或者是為了突顯別的門派，貶低了全真派，其實這是他們對歷史不熟悉才會有這樣的誤解。

全真派不是虛構的，這個有個問題，是歷史原因造成的。

全真教在歷史上是真的有，金庸小說盡管虛構的多，但他都會把歷史揉進去，這樣才讓讀者有代入感，彷彿那群筆下的人物是真實存在過的。

所以金庸才會有浙大歷史博士導師的頭銜，雖然是虛銜，也就是所謂名譽博士，但這也從一個方面肯定了他的才華。

因此我們來看金庸筆下的射鵰三部曲是什麼時代背景——宋元明。

而這個時代恰恰是全真教的創立興盛和衰敗完整的過程。

王重陽創立了全真教，帶有一定的政治目的，就是抗金，這是因為宋朝積弱多年，他作為一個愛國志士，在戰爭失敗又被奸臣排擠後，難免心灰意冷，轉頭著書立派，廣收門徒，於是就有了全真七子。

當然歷史上的全真七子是沒有什麼絕頂武學的，但是學問就相當有水平了，丘處機最為著名，他帶著弟子去遊說成吉思汗，還寫了一本《西遊記》，不過這是真的西遊日記，不是神話小說。

他的觀點得到了成吉思汗的認可，這就是全真派的高光時刻。所以金庸就會在射鵰的前兩部把這一時期的全真教寫成四絕之一，這是很符合歷史的。

但是，物極必反，盛極而衰。

全真教空有濟世之心，卻無辨識之能才，更不懂詭辯之道。

金庸也在小說裡寫了丘處機教徒無方，用楊康影射了丘處機沒能把詭辯之道傳授下去，自己是辯才中的高手，卻不能教出像樣的徒弟，結果目空一切的全真教遇到了死對頭——以八思巴為首的喇嘛教裡的一個詭辯神童，一場決定生死的辯論開始。

就彷彿小說裡楊康和郭靖的過招，堂堂丘處機，竟然敗給了江南七怪，我甚至猜測，這江南七怪就是影射的元朝國師！結果自然是笨嘴笨舌的道教在詭辯面前大敗虧輸，失去了統治者的支援，這時候是元朝中期，全真教從此一蹶不振。

倚天屠龍記就在這一時期的事情，金庸要寫這時期的小說，自然查閱熟悉這段歷史，全真教已經不堪大任，小說裡自然也就讓它銷聲匿跡了！

可以說，金庸還是很懂春秋筆法的。

大師已去，江湖夢醒！

至此，武林中再無大師！

全真教沒有消失，而是一直都很繁盛，道場也很多，有三大祖庭～重陽宮，永樂宮，煙霞宮，四大仙山～武當山，終南山，崑崙山，富景山，是中國道教的絕對主流。

元朝時曾大修武當山，明朝時更是成為皇家道場，武當山是的全真教集大成者，香火最為昌盛。

《倚天屠龍記》裡，武當山，全真教，武當七俠和張三丰的關鍵情節篇幅很多，不知提問者為何說全真教消失云云。

倚天屠龍記是元末明初，歷經了幾百年，全真教早就沒了。其實到了後期全真教，也沒有什麼能頂梁的人物。如果楊過留在全真教，可能還有得一出，但是自從全真七子以後，這還真的沒聽說全真教出過什麼人才。

所以說全真教必定會沒落的，其實何止是全真教，時間能淘汰一切。到了現在，恐怕唯一還存在的就是丐幫了。

元朝中期。朝廷組織佛道大辯論，全真掌教李志常大敗而歸。從此全真教被佛門密宗紅教排擠。趕出朝廷，一落千丈。從此逐步衰落

如果單論神鵰三部曲，可以發現全真教的王重陽和周伯通雖然武功高強，帶徒弟卻不行。王重陽之後有全真七子，全真七子都沒有學過九陰真經，倒是被古墓派的小龍女和楊過得了真傳。全真七子除了馬鈺和丘處機，其他再無建樹。丘處機雖然高齡，徒弟楊康，甄志丙之流都不是好徒弟。唯一出色的郭靖，還不完全算是全真教，後來還在襄陽城戰死了！

周伯通就收了一個徒弟，還是一個落魄的貴族，他娶了郭芙，一方面是避禍，一方面也算是攀高枝了！對郭芙情意也是有限！

孫不二收的徒弟成了家庭婦女。

郝大通殺了孫婆婆，被小龍女打敗差點自殺！自身武功有限！

全真教後來被火燒，周伯通揹著經書到處逃亡！

全真派從此失傳，沒有武功卓絕的高手，沒有統治能力高強的徒子徒孫！全真教就此湮滅！

由於丘處機與成吉思汗的關係，道教在蒙古帝國前期勢力很大，這不但使佛門弟子不滿，而且引起了蒙古統治者的不安，所以聯合起來對道教進行了打壓。

1254年蒙哥（就是那個在神鵰裡被楊過飛石打死，實際上是在釣魚城被炮轟死的）組織了一場宗教辯論會，佛教徒和伊斯蘭教、基督教聯合起來批駁道教，而全真教心知被統治者猜忌，只能沉默以對。

四年後，一次更大規模的對道教的圍剿開始了。這次佛教這邊有了一個不世出的奇才——八思巴。他以雄辯的口才使全真教一敗塗地，而失敗的代價是1.參加辯論的17個道教代表被迫剃髮為僧。2.大量道教經典被焚燬。3.幾百處道教道場變成了佛教寺院（據說是道教侵佔佛教的）

遭此打擊，全真教聲譽一落千丈。八思巴任國師後，在蒙元統治者持續打壓之下，北方的全真教逐漸風流雲散。