後備豬是每個級別種豬場（GGP、GP、PS）的未來，對核心育種場來說，後備豬的選種顯得尤為重要。一般來說，後備豬的選種包括選留時間、外形評定、效能測定和選種程式四個方面。

1）、選留時間。後備豬的選留節點一般分為初生、斷奶、8周、14周、20周、入群前的抗體檢測六個階段，各階段根據具體的要求嚴格進行選留。

2）、外形評定。豬的外在形態和外貌特徵，包括外貌、體型、體質、肢蹄等肉眼能觀察到的外部特徵。外形評定一般把豬分為五個部分來觀察，即頭頸部、背部、後軀部、腹部和肢蹄部，然後再進行整體觀察，同時考慮第二性徵的發育和遺傳缺陷等內容，分項評分後再進行綜合打分。其中，遺傳缺陷具有一票複決權。

3）、效能測定。效能測定是獲得個體在有關性狀上表型資料的重要手段，是促進遺傳進展的重要工具。效能測定一般包括生長效能測定、繁殖效能測定、肉質效能測定和健康效能測定。透過以上四個方面的表型資料的測定及統計分析，最終對種豬效能進行綜合評定，為後備豬最終是否被選留提供重要的參考依據。目前後備種豬的選擇主要依靠生長效能及繁殖效能測定的資料。生長效能測定包括日增重（30-100kg）、達100 kg體重日齡，活體背膘厚、眼肌面積、飼料轉化率、蹄腿強壯度、乳頭數等專案；繁殖效能測定包括總產仔數、產活仔數、斷奶仔豬數、出生窩重、21日齡窩重、從斷奶到配種的天數等專案。一般流程如下：

4）、選種程式。選種程式一般包括：選種工具準備---檢查欄中備選種豬的耳號---檢查健康、毛色，體重和周齡是否於周齡相符---檢查符合種用的外觀---標記---記錄。