棉籽的脫絨方法，一般分為機械脫絨和化學脫絨兩大類。(1) 機械脫絨用機器的拉力剝去棉籽上的短絨。如用鋸齒式剝絨機，經2次脫絨後，便可剝去種子上大部分的短絨。所剝下的短絨是紡織、造紙、醫藥、化工等輕工業的上等原料，有較高的經濟價值。

但機械脫絨不夠徹底，在種子上一般還會殘留約10%的短絨，使種子的流動性差，不利於種子的精選加工;殘留的短絨中，仍會潛藏某些病菌;且易造成種子破損，降低發芽力；脫絨機械的維修保養費用大;還會產生粉塵汙染。

(2) 化學脫絨用酸性溶液，炭化、燒除種子上的短一絨。① 濃硫酸脫絨用92%以上的工業硫酸以每10千克棉籽加1 000毫升硫酸的比例，均勻地潑灑在棉籽上，邊灑邊攪拌，直到棉籽發黑為止。 在常溫下，一般用20分鐘便可脫完。 脫絨後的種子還需進行風選、篩選，除去破籽、病菌、蟲體等。處理過的種子應及時播種，以免影響種子的發芽、出苗。 ② 稀酸脫絨將濃度為93%〜98%的工業硫酸稀釋成 7%〜9%的稀酸，按酸與種子1 : 50的比例，用稀酸充分溼潤種子的短絨，經烘乾後，使短絨脆化，再經摩擦後，便可消除種子上的短絨。 該法工藝成熟，脫絨效果好，用酸量和耗水量均少，多餘的酸液還可回收，成本低，對環境的汙染輕，處理時也不受氣候條件的影響，是目前較理想的方法。 ③ 泡沫酸脫絨將濃度為9%〜10%的硫酸和發泡劑混合，使硫酸發泡，而提高其滲透力並增大表面積。然後將一定量的泡沫酸覆蓋在棉籽表面，利用毛細管的作用，使硫酸被吸收到短絨內，經乾燥會使短絨內的硫酸增多而被炭化,最後經摩擦便可脫去短絨。此法是在稀酸脫絨法的基礎上發展起來的，不僅耗能少、成本低、對環境的汙染輕，對種子本身的生物學特性影響小，只是對工藝、技術條件要求較高。