柯南被黑衣人餵了APTX4689變成小孩子以後第一時間去找了阿笠博士。柯南的爸媽三年前就去了美國，家裡只有柯南一個人。此時的柯南可以說遭遇了人生重大變故，即使柯南保留了聰明大腦，但是身體的縮小還是會帶來諸多不便，沒有大人看顧很不安全。

阿笠博士和柯南是非常要好的朋友，在這種時刻是不是應該照應一下受到創傷的柯南呢？沒有啊，阿笠博士乾脆果斷的拒絕了柯南，並把柯南交給了前來尋找工藤新一的毛利蘭。

同樣的情況，當灰原哀身體變小並被黑衣組織追殺時，阿笠居然不怕，冒著風險收留了灰原哀。這是什麼情況，阿笠博士此前認識灰原哀？為什麼他不肯收留老相識柯南卻願意收留素不相識的灰原哀呢？【每個問題的背後都有一個答案，讓我們撥開迷霧，探尋答案吧。】

如果是工藤新一，自然不用阿笠博士照看，畢竟工藤新一的生存能力很強，可是現在他已經成了一個只有五六歲的小孩子，連門把都夠不著，力氣也很小，如果遇到壞人根本沒有力氣反抗。

阿笠博士當然知道這些，關於他為什麼不能收留柯南，他給出了自己的理由：

①：繁忙的單身漢

②：要搞研究照看不過來

這三條理由說的也挺有道理，站在他那個角度，會這麼想也不奇怪。當然柯南之所以會接受，完全是因為他最後一句留在毛利蘭家裡可以尋找黑衣人的線索。所以被阿笠博士忽悠過去毛利偵探社，從此開啟了毛利代理偵探的生涯。

柯南原以為只有自己才是APTX4689的受害者，沒想到遇到灰原哀以後才發現原來她跟他一樣，也是因為吃了這種藥而變小了身體，最可怕的是這種藥就是灰原哀發明的，雖然只是半成品。

當年灰原哀企圖逃走被琴酒抓住關了起來，灰原哀不想過這種受制於人的日子，並且那些毒藥她也不願意研究出來害人，她吃下APTX4689想一死了之，沒想到沒死成身體反而奇蹟般的縮小了，這給了她逃走的機會。

灰原哀雖然逃了出來，但是因為身體太小，跑不快，很快就被黑衣人追查到，被黑衣人重傷的灰原哀抬去了阿笠博士暫避，至此，灰原哀在阿笠博士家住了下來。

阿笠博士為什麼不願意收留柯南而願意收留灰原哀呢？三個原因：

1、柯南有現實的監護人

不管怎麼說，柯南的父母還在世，而且是他的監護人，阿笠博士一個單身漢照顧一個有監護人的小孩，明顯不合常理。

2、柯南住在阿笠博士隔壁

之前說到柯南和阿笠博士是老相識，除此之外，他們還是隔壁鄰居，柯南就住在阿笠博士隔壁。因此，即使阿笠博士和毛利蘭不收留柯南，阿笠博士也會經常去隔壁看柯南的，沒必要把他收留在身邊。

3、灰原哀孤苦伶仃

灰原哀的父母不知下落，家人不知所蹤，無依無靠，身世比柯南可憐的多，且她一個女孩子，還到處遭黑衣人追殺，隨時都有生命危險。阿笠博士喜歡搞研究不假，可他也非常善良，因此收留了無家可歸，無依無靠的灰原哀。

灰原哀留在阿笠博士家中後不僅是有了安身之所，對於她研究解藥和躲避黑衣人也是有莫大的好處，所以，刨除以上理由不談，為了劇情發展，原著作者也會安排阿笠博士收留灰原哀。

【總結】：柯南和阿笠博士那麼好的交情都無法留下，素不相識的灰原哀卻留在阿笠博士家中了，關於這其中的玄機，綜合以上分析，主要分為3個原因：

1、柯南還有監護人。不管柯南的身體怎麼變小，他的父母還在世，也就是說他有監護人，這就沒阿笠博士什麼事兒了；

2、柯南寄住在毛利蘭家裡可以尋找黑衣人的線索，阿笠博士家中只有發明，一對比，肯定毛利蘭家裡合算；

3、灰原哀孤苦無依。灰原哀身世悲催，父母不知所蹤，身體變小後還遭到黑衣人追殺，十分可憐，善良的阿笠博士於是收留了她。