無論在中國還是國外，消費者都覺得，現在的西紅柿味道不如以前鮮美和酸甜了，也就是西紅柿味少了。有人把原因歸咎於轉基因西紅柿，這可冤枉了轉基因技術，那些味道變差的西紅柿並不是轉基因西紅柿，而是一般的傳統栽培的西紅柿。

來自美國、英國、中國等14個國家的科學家經過研究後發現，西紅柿不好吃，是西紅柿裡的一個基因失去了活性所致，這個基因就是決定西紅柿糖分的。

由於西紅柿基因組的破譯，研究人員認為西紅柿味道變差的原因是控制西紅柿味道的基因發生了突變。現在的西紅柿越來越漂亮，越來越鮮紅和豔麗，但或許這樣的西紅柿還不如頂部有青色的西紅柿的味道更鮮美，因為後者的含糖量更多，而這就是由一種特定基因控制的。

美國研究小組發現，野生西紅柿和人工栽培的西紅柿在顏色上有顯著不同，前者有深綠色的頂部，而後者沒有。於是，他們把野生西紅柿與人工栽培西紅柿進行雜交，在西紅柿的10號染色體上確定了一個基因，稱為SIGLK2。SIGLK2能增加葉綠體的形成。葉綠體是植物細胞中進行光合作用的部位。由於野生西紅柿的葉綠體更多，使得野生西紅柿的顏色更綠。而且，葉綠體用它們捕獲的光能將二氧化碳和水轉化為糖。所以，野生西紅柿的糖分比人工栽培的西紅柿多一些，而西紅柿中更高的糖含量會讓西紅柿更美味可口。

隨後，研究人員分析了12個人工栽培的西紅柿品種，這些西紅柿的SIGLK2基因都發生了變化，從而讓這一基因失活。

另一方面，包括西紅柿在內的很多作物的產品的味道不只是與基因有關，而且與栽培的土壤、日照、降雨、種植的時間等許多因素有關，同時與收穫、採摘和貯存運輸的時間和方式有關。