有機物向無機物分解主要是透過微生物的分解作用。

有機物主要結構是碳骨架，還有磷、硫、氮等元素，當然還有一些金屬元素。

細菌透過自身的呼吸代謝，將有機物的碳骨架分解，在有氧氣狀態下，碳骨架多被分解為二氧化碳，無氧條件下多被分解為酒精或乳酸，釀酒和酸奶就是這麼個原理。

而有機物中的其他元素，如氮元素，將透過脫胺代謝等過程，最終以銨根離子的形式放出。硫元素可以變成硫酸根、亞硫酸根、硫離子等。磷元素可以變成磷酸根。

題主說的細菌等微生物將大分子分解為小分子，其實是可以繼續將小分子分解為無機物的，比如將澱粉分解為葡萄糖，進一步利用葡萄糖分解為二氧化碳和水。光合細菌也是一樣的代謝，只不過光合細菌可以利用二氧化碳再生產大分子有機物。

其實有機物產生無機鹽這個問題本身是不確切的，有機物分解產生的不一定是鹽，絕大多有機物還是將變成二氧化碳和水。

水產中的有機物是怎麼分解成無機鹽的？有機物的化學鍵中儲存了能量的，當水產中的有機物被細菌感染繁殖，細菌把水產有機物轉化成新的細菌，得到細菌的大量繁殖，又釋放無機鹽。有些有機物和無機鹽被可以進行光合作用的藻類利用，並大量繁殖，進行藻類的增生。這些藻類又被魚類食用代謝，成為新的有機物和無機鹽。魚類在新陳代謝中，有有機物和無機鹽的產生，當水產中有機物被分解成生物能量最低的，完全無法利用的無機鹽時（多次生物迴圈以後），水產中的有機物就以無機鹽的成份穩定在環境中。完成徹底分解。其過程中，有光、氧氣生化條件等參與的生物和無機物的氧化還原反應。

針對你的這個觀點是可行的，芽孢主要讓大分子分解，讓水體中的無機物進行轉化。

光合菌主要利用小分子無機物，進行轉化，菌中基本在水產中表現的是分解作用，轉化後的無機鹽，小分子被水體中的藻類等進行吸收。