首先來看CT和核磁共振的成像原理：

CT屬於密度成像，是透過X射線穿透人體後，因為人體不同組織密度不同，對射線的吸收率不同，通過後處理系統產生的密度差別的影象。射線對人體有一定害處（偶而的檢查對人體的損害很小）。優點是檢查速度快，密度分辨力好。

核磁共振（MRI）是水質子成像，利用外加磁場改變水質子周圍電子的自旋方向，然後透過這個原理產生的質子成像，核磁共振機使用較強大的磁場，使人體中所有水分子磁場的磁力線方向一致，這時磁共振機的磁場突然消失，身體中水分子的磁力線方向，突然恢復到原來隨意排列的狀態。目前為止沒有發現核磁檢查對人體有明確傷害。核磁檢查在神經系統、關節軟骨、軟組織病變等方面獨具優勢；在腹部的臟器病變檢查方面因為訊號的變化更豐富，診斷效果也更好一些。

在臨床實踐中，一般的疾病透過CT或MRI檢查的結果幾乎沒有區別，對於疾病診斷的準確率差不多，檢查費用區別不大，都可以選擇。但是對於特殊部位的疾病來說，略有區別。

比如對於直腸癌來說，術前的分期檢查，胸部和腹部一般推薦選擇增強的CT，而對於盆腔檢查標準的要選擇增強的MRI，因為MRI對於軟組織的解析度更高，更好看到腫瘤浸潤直腸壁層次深度，就是判定腫瘤的T分期，另一方面，也更容易鑑別直腸腫物淋巴結的轉移情況、腫瘤對直腸繫膜是否累及，MRI比CT有優勢。

但是對於直腸癌術後複查來說，臨床中CT或MRI都可以，因為常規的複查，主要看有無腫瘤復發，不涉及腫瘤對腸壁侵犯的瞭解，即使有問題，CT完全可以發現。因為MRI檢查費時，預約時間較長，如果患者想檢查的快一點，可以選擇CT，如果對預約時間沒有要求的話，可以選擇MRI。檢查的效果對於術後複查來說沒有區別，都可以。

一般一年後複查需要看胸部，腹部和盆腔有沒有轉移和復發。

胸部選擇低劑量高分辨CT掃描，比胸片準確，放射劑量也不高。

腹部選擇增強CT較好，可以觀察肝臟和腹腔有沒有轉移。有時候發現肝臟的小結節，如果難以判斷是否轉移，可能需要再做一個肝臟MRI的檢查。

盆腔首選MRI，核磁沒有輻射，軟組織解析度高，適合觀察盆腔有沒有復發和轉移。