宇智波一族要進行政變，木葉上層害怕發生內戰。要是內戰中敵國再趁虛而入，木葉忍者村就玩完，宇智波止水想用萬花筒寫輪眼別天神來阻止政變，但右眼被團藏奪走了，止水將左眼交給鼬，木葉上層下令屠殺宇智波一族，鼬很苦惱，但鼬想到，如果不殺光全族不會給村子帶來和平，也不給族人帶來和平，也不會給佐助從戰爭的痛苦中解脫出來，鼬含著痛苦殺光了全族，加入了“曉”組織，這就是宇智波一族被滅的真相。

為了讓宇智波的策反計劃失敗，木葉高層命令宇智波鼬去殺了所有族人。這才有了宇智波鼬屠殺同族的故事，才有了揹負真相活在陰影下的宇智波鼬，為了宇智波鼬獻上禮炮！真正的忍者，誰能忍受手刃父母的痛苦，為了大的和平，犧牲自我，這樣的人物，值得我們每一個人去尊重！

宇智波一族被滅族的最終原因在於：二代火影千手扉間為了防止第二個宇智波斑出現；

為此，二代火影千手扉間對曾經建立木葉忍村的宇智波一族實行邊緣化政策，設立宇智波警務部，明目張膽的打壓，強行將宇智波一族安排在木葉忍村的角落，成為了一切的根源；二代火影千手扉間戰死之後，猿飛日斬繼任第三代火影，以及曾是千手扉間屬下的水戶門炎、轉寢小春、志村團藏是木葉高層舉足輕重的人物，因此，木葉忍村與宇智波一族之間的矛盾持續惡化；宇智波帶土控制九尾襲擊木葉，而宇智波一族並未參與戰鬥，只是進行護衛，木葉忍村重建的時候，宇智波一族更是直接被安排到忍村的邊緣地帶，簡直就是隔離，矛盾不斷惡化以至於達到內戰的地步；

宇智波止水本想利用幻術別天神控制宇智波，化解雙方的矛盾，不料想，團藏這個老混蛋帶領暗部根阻止，止水無奈之下，將一切託付給摯友宇智波鼬，自己跳崖自盡；

三代火影猿飛日斬想以談話的方式化解矛盾，只可惜，團藏暗地裡命令宇智波鼬執行滅族任務，而小春、炎也在此次事件中發揮著舉足輕重的作用；這三個老傢伙就知道瞎搞；

因為宇智波一族的人，其強大源於腦子有病，能在悲劇時激發某種特殊查克拉。看看漫畫那些明確開過萬花的六個宇智波，在乎一族死活的，一個都沒有，反倒有三個想滅族。這不是腦子有病很重的直接體現嗎？

火影中的宇智波一族，總是給人無比強大的感覺。在忍者天賦上擁有的是血輪眼，並且在開眼後，能夠迅猛的提升實力。在火影中最重要的對戰部分，就是宇智波斑挑戰忍者世界，引起了忍者大戰。可見，宇智波的實力是多麼強悍。可是為什麼會被鼬直接滅族了呢？如果說是歷史可以重來，宇智波一族能否改寫歷史呢？

首先，我們知道的是鼬神從小就被譽為是宇智波的驕傲，所以早早的就被選拔進入到了三代火影的暗部之中，擔任的是小隊長一職。從小被灌輸的就是"木葉高於一切"一定要守護村子的理念。其次，宇智波一族本身就抱團，並且不服管理，甚至有密謀謀反，是木葉的內患，已經造成了村子裡面的嚴重內耗。再次，在忍者的世界裡，強者為王，鼬神的實力價值要遠遠大於其他人。最後，也是透過這次任務，保全了二柱子，這樣可以在以後將親愛的弟弟培育長大，為二柱子的上位掃清各種障礙。

而且透過這個滅族的事情，鼬成功作為木葉的臥底，直接潛伏進曉組織，能夠為村子掌握到最及時的外部資訊，本身也就是在守護村子的安全。同時，還可以讓三代多加照顧二柱子。對鼬神來說，一方面是可以給二柱子積極的有動力的生活方式，另一方面也是在認真踐行自己守護村子的責任和理念。木葉能夠掌握到外界的高階資訊，包括各種陰謀，鼬是一個最佳的幫手。看似冷酷絕情，其實呢卻內心堅定，是當之無愧的守護者。

但是鼬神應該是沒想到，自己精心佈置的這一套計劃，原本天衣無縫的，二柱子按照既定的路線，學習本事，走上了光明的忍者之路，卻在自己死後，被帶土帶偏，成了木葉的叛忍，想要覆滅村子。好在最後還是兩個兄弟間將誤會解除，二柱子也重新迴歸村子，以守護者的身份，來共同保衛木葉的安全。

綜上來看，即便是歷史能重來，鼬神應該還是會選擇這條道路，以他一個人的實力滅了宇智波家族，去保護和守衛他的信念。忍者從來都是優勝劣汰，很強大卻也很殘酷，所以即便是沒有鼬神，也會有下一個人代為執行。所以，滅族的事情是絕對不可避免的了。

宇智波家為什麼會被滅族？

直接原因就是宇智波的族人密謀造反，既然你要造反，而且還被我火影知道了，那麼正好，我也就不留你了，不需要其他莫須有的罪名。

但是糾其原因，那始終還是歷史遺留問題。千手家畢竟最初和宇智波家是對立的，是樂天派的千手柱間強行把宇智波斑拉攏的，可是千手家的其他人也未必會認可宇智波家。而木葉村是千手柱間建的，政治領導基本上都是千手那個圈子，一代二代千手家的人，三代二代徒弟，四代二代的徒弟的徒弟的徒弟，五代是一代的孫女。不過五代和宇智波家滅族沒有關係，三代（第二輪）時期，宇智波家被滅了。

所以這就是陣營問題了，宇智波家被冷落也是必然。

另外一點就是他們家的人不僅僅被冷落而且還被壓迫，越來越邊緣化。初代還在的時候，宇智波家的人還有點地位，但是位置一到了扉間手上，各種對宇智波家的政策一出，宇智波家慢慢被邊緣化。而在扉間的影響下，木業村民們自然也會有意無意的忌憚宇智波家的人。

於是終於到了忍無可忍的時候，於是要密謀造反，於是火影陣營就順水推舟讓宇智波鼬滅了這個族。

另外宇智波家的擁有寫輪眼，這就是實力的代表，宇智波家的人由於實力超強，所以才會讓扉間更加需要忌憚。

宇智波家族被滅密謀造反是直接原因，歷史遺留問題是根本原因。

很簡單，因為他們打算叛亂，止水想用別天神控制宇智波高層改變叛亂的想法，但是被團藏奪取一個眼睛，於是他把另一個眼睛送給了鼬，一打七從小就參與戰爭，很小就會火影式的考慮，知道如果叛亂會造成什麼結果，於是他聯合帶土（不是斑，斑只能靠十尾魔像活著，不能動，而帶土是他的棋子和打手罷了，可憐這兩兒都是黑絕的棋子）一起滅了除了他弟弟以外所有人，說到底就是沒有和平相處，互相猜疑才會這樣。