嚴格來講，免疫系統的非正常反應都算是對其的破壞。這麼看來免疫系統疾病其實很多，不過常見的並不多。比如超敏反應(也叫變態反應或者過敏反應)中的過敏性哮喘、過敏性休克、蕁麻疹、新生兒溶血癥、血型不合的輸血反應、接觸性皮炎、移植排斥反應什麼的。這些既有對“自己”的排斥,也有對“異己”的排斥。生活中常說的“過敏”就是吖。

另外一種就是免疫缺陷病。這是一類因為免疫系統先天發育不全或者後天因素導致的免疫功能低下或缺乏,臨床表現主要是一系列的綜合徵。分為原發性免疫缺陷病和繼發性免疫缺陷病。原發性免疫系統缺陷病可發生於免疫系統發育成熟的各個環節,多為染色體隱性遺傳。比如系統性紅斑狼瘡、類風溼關節炎、選擇性IgA或IgM或IgG缺陷病、性聯無丙種球蛋白血癥、先天性胸腺發育不全(DiGeorge綜合徵)。而繼發性免疫系統缺陷病發病原因有很多種主要有感染、腫瘤、營養不良、藥物作用等等。

這裡還是不得不提一下眾所周知的艾滋病，它就是人類免疫缺陷病毒感染引起的獲得性免疫缺陷綜合徵。由於腫瘤細胞本身對免疫系統的損傷,惡性腫瘤病人大都伴隨免疫功能缺陷。

免疫系統（immunesystem）免疫系統是生物體內一個能辨識出“非自體物質”（通常是外來的病菌）、從而將之消滅或排除的整體工程之統稱。

免疫系統主要由淋巴器官（胸腺、淋巴結、脾、扁桃體）、其它器官內的淋巴組織和全身各處的淋巴細胞、抗原呈遞細胞等組成；廣義上也包括血液中其它白細胞及結締組織中的漿細胞和肥大細胞。外來物質，艾滋病毒，狂犬病毒，病菌等都需要免疫系統做出對抗，對抗過程中會讓免疫系統消耗掉吞噬細胞等對抗體。

面板屏障也屬於免疫系統一部分，痘痘也會讓面板免疫功能下降

免疫缺陷病是指機體的免疫系統的器官、免疫活性細胞包括淋巴細胞、吞噬細胞、免疫活性分子如Ig、補體成分和細胞膜表面分子發生缺陷引起的某種免疫反應缺失或降低，導致機體防禦能力普遍或部分降低的一組臨床綜合徵，比如艾滋病就是病毒攻擊了機體主要是細胞免疫功能引起的機體疾病。

免疫缺陷病可以分為原發性和繼發性兩大類，原發性主要指一組由於遺傳性的、種類繁多的疾病，涉及固有免疫系統和獲得性免疫系統各組分，目前已證實的基因缺陷超過120種，導致約150種原發性免疫缺陷疾病。2003年的葡萄牙辛特拉會議上專家將主要分為8類：聯合免疫缺陷病、抗體缺陷為主的免疫缺陷、其他定義明確的免疫缺陷綜合徵、補體缺陷病、免疫失調性疾病、先天性吞噬細胞數量和或功能缺陷、固有免疫缺陷、自身炎症反應性紊亂。

繼發性免疫缺陷主要指由於後天因素包括藥物、理化、感染、營養、疾病、生理發育不成熟、老年退化等引起的機體免疫系統缺陷所致疾病群。繼發性免疫缺陷多以輕度反覆感染居多，原發疾病較為明確，損傷的免疫系統環節多，但僅為部分功能受損，表現為免疫功能低下，而不是缺失，且難以檢測免疫系統受損的具體環節，而且受後天環境因素影響。

營養紊亂是最常見的繼發性免疫缺陷的原因，在發展中國家尤為常見。中國從1980年開始對缺鎂引起的免疫損傷機制和治療進行了廣泛的研究，1990年又對亞臨床維生素A缺乏致免疫缺陷情況進行研究發現維生素A缺乏會引起自然殺傷細胞活性下降、淋巴組織萎縮、T細胞減少、B細胞產生抗體能力下降、區域性粘膜免疫反應減弱。一些臨床疾病除本身的病理改變外，常伴隨免疫缺陷的表現，比如腎病綜合徵低IgG血癥，腫瘤患者，淋巴系統腫瘤、白血病、再生障礙性貧血、多種染色體異常疾病、血紅蛋白病等。

很多疾病會破壞人體的免疫系統——1、艾滋病，2、甲亢，3、紅斑狼瘡，4、類風溼，5、萎縮性胃炎，6、結腸炎，7、神經炎，8、肝硬化，9、皰瘡，10、肺炎。以上為最常見的10種免疫性疾病，如果不治癒，這些疾病無時不刻都在攻擊人的免疫系統。

這裡面既有原發的，也有後天感染的。

還有人體的免疫系統不是越強越好，有時候免疫系統會錯誤攻擊自身器官，造成另一種免疫缺陷。比如：肝炎、內風溼、甲亢、紅斑狼瘡等。

還有過敏症，過敏體質的人，身體會長期缺乏某種營養，因為這種缺乏是永久的，不可替代，對免疫系統有損害。