當海報和片頭反覆告訴你“本片基於真實故事改編”的時候，往往是在暗示你即將看到一個超乎想象的離奇故事，《蝴蝶君》便是如此。1960年代，法國外交官高仁尼觀看歌劇《蝴蝶夫人》時，被蝴蝶夫人的扮演者、身為京劇名伶的宋麗玲深深吸引，兩人逐漸發展為情人關係，宋麗玲還為高仁尼誕下一子。文革爆發，宋麗玲被紅衛兵帶走，高仁尼也遭黜回國，並陷入對情人的思念之中不能自拔。忽然有一天，宋麗玲又出現在高仁尼的面前，狂喜當中的高仁尼答應了宋的一切要求，並與之度過了兩年美好時光，直到調查局情報組的人出現在他面前。法庭上，高仁尼對於將國家情報洩露給中國情人供認不諱，只是他萬萬沒有想到，他的中國情人，竟然是一名男子。

《蝴蝶君》故事的原型，是上世紀八十年代震驚一時的中法間諜奇案。1964年，當法國駐華使館工作人員伯納德·博斯考特（Bernard Boursicot）結識了講一口流利法語的京劇男旦時佩普的時候，還以為遇見了自己的真愛。殊不知這正是中國情報部門導演的一出虛凰假鳳的好戲。時佩普甚至從新疆抱來一個金髮碧眼的嬰兒，謊稱是兩人愛情的結晶。對此堅信不疑的伯納德，為了愛人和孩子，將許多法國外交檔案源源不斷地送到了中方的案頭。1982年，伯納德終於能夠帶著“嬌妻愛子”離開中國。但不久之後便案情敗露，兩人雙雙入獄，伯納德這才得知真相。絕望的伯納德企圖割喉，然而自殺未遂，出獄之後在養老院了此殘生。而時佩普在獲得總統特赦後隱居巴黎，於2009年與世長辭。

兩人交往十八年，竟不知真實性別，這的確讓人感到匪夷所思。美籍華裔劇作家黃哲倫，卻能夠撥雲見日，將同性戀情、間諜奇案這類通俗八卦化為皮囊，以“蝴蝶先生”顛覆《蝴蝶夫人》用作骨肉，讓民族與種族、東方與西方、性別與政治、身份與認同，乃至殖民與後殖民等重大文化命題的探討撐起整部劇作的精魂。

“蝴蝶夫人”正是西方強加給東方的一件無比美麗又極其卑賤的衣裳，裹挾在其中的早已不是東方原初的身體，而是經由西方打碎、根據自己的利益與喜好重新拼貼出的東方形象。因而無論是小腳搖曳的中國女人，還是煙不離口的東亞病夫，都如同九頭怪獸或是三足貓一樣，是一份敷衍意淫的產物，與本源早已相去甚遠，然而卻能讓西方白人在神秘化、妖魔化的“東方”面前登時獲得自信，顯現出強健偉岸的“自我”形象，美化對東方施加霸權與壓迫的叵測居心。黃哲倫能夠以此為喻，以取道西方話語作為策略，創造出了一個“蝴蝶先生”，開始了對“蝴蝶夫人”的模擬與反諷，貌似捧場，實則拆臺。《蝴蝶君》全片，若荊軻刺秦，直到圖窮匕見，才陡然亮劍、一招克敵，讓我們感覺到了打破西方“東方主義”的痛快淋漓。

真實事件改編，法國外交官伽裡瑪看過歌劇《蝴蝶夫人》後，愛上了舞臺上蝴蝶夫人的扮演者宋麗玲，殊不知宋麗玲一直以間諜身份男扮女裝與他接觸。尊龍扮演的宋麗玲在雌雄之間轉換，優雅而嬌媚，當時讓無數人沉浸在他的美麗中。一出《貴妃醉酒》，甚至有人拿他跟張國榮的“程蝶衣”相媲美，《蝴蝶君》和《霸王別姬》題材上很相似，都出自1993年，當時因為種種原因《霸王別姬》的男主給了張國榮，其實本來是要給尊龍的。