高速公路對於動物的影響包括對獸類影響、對鳥類影響、對爬行類影響和對兩棲類影響。1、獸類動物主要生存於山林之中，假如高速公路多以隧道形式透過，在施工期可能對其有輕微的影響，運營期則基本上沒有影響。高速施工對獸類的干擾和破壞，主要發生在沿線的施工區域；施工人員的生活活動對獸類棲息地生境也會造成干擾和破壞；施工機械噪聲對獸類的驅趕；施工人員可能對獸類的獵殺。這些影響將使大部分獸類遷移它處，遠離施工區範圍。由於獸類會透過遷移來避免高速施工對其造成傷害，所以高速施工對獸類的直接影響不大。2、高速施工活動會對鳥類棲息地生境造成干擾和破壞。施工砍伐樹木、施工機械噪聲等，均會直接或間接破壞鳥類棲息地，破壞巢穴，干擾灌叢棲息鳥類的小生境。施工人員會捕捉鳥類，或者其生活活動對鳥類棲息地也會造成干擾和破壞。這些影響，其結果將使大部分鳥類遷移它處，遠離施工區範圍；小部分地棲和灌木林棲鳥類由於棲息地的散失而從高速區域消失；一部分鳥類的種群數量由於巢穴被破壞而減少，特別是當施工期正在鳥類的繁殖季節中時（夏季）。總的結果是高速區域範圍內鳥類的種類和數量將減少。由於大多數鳥類會透過飛翔和短距離的遷移來避免專案施工對其造成傷害，故高速施工對鳥類的影響不大。3、高速施工對兩棲和爬行動物的影響主要包括對其棲息地生境的干擾和破壞，特別是對兩棲動物的交配活動，產卵和卵的孵化以及蝌蚪的生長等影響更大；施工機械噪聲對兩棲和爬行類的驅趕；施工中對溪流、水塘、水溝的挖方和填方將對兩棲和爬行類，特別是對兩棲類小生境造成破壞；施工人員對兩棲和爬行類的捕捉等。這些影響將使大部分爬行動物遷移它處，遠離施工區範圍；大部分兩棲類由於棲息地的破壞和散失而在專案區消失，特別是在繁殖季節；一部分兩棲和爬行類由於巢穴的被破壞而減少。總的結果是它們在高速範圍內的種類和數量將減少。當然，由於大多數爬行動物和兩棲動物會透過遷移來避免專案施工對其造成傷害，所以高速施工對它們的影響不會太大。高速公路營運期對陸生動物的影響除產生阻隔效應外，主要為交通噪聲和夜間車輛行駛營運期對陸生動物的影響除產生阻隔效應外，主要為交通噪聲和夜間車輛行駛時燈光對動物的棲息和繁殖有一定的不利影響，其中噪聲汙染影響顯著，動物選擇生境和建立巢區時通常會迴避和遠離高速公路。總體影響較小。