1. 選擇抗病品種
如中棉所24號、27號、35號、36號、豫棉19號、新陸早9號、10號等基本上都是抗病品種，對枯萎病的防治上都起到了至關重要的作用。但抗病品種應不斷篩選，同時與優良的栽培措施相結合，即良種良法配套，這樣才能使抗病性得到充分發揮。
2. 實行輪作倒茬
枯萎病菌在土壤中存活年限雖然相當長，但在改種水稻的淹水情況下較易死亡。合理的輪作倒茬，特別是與禾穀類作物輪作，可以顯著減輕發病。重病田改種玉米和小麥4年後，枯萎病發病率壓低至1%以下，而且消除了死苗現象。此外，油菜壓青對棉花枯萎病也具有一定防治作用，此方法簡單易行，有很大可行性。
3. 加強栽培管理
枯萎病病殘體能傳播病菌，加重危害，因而注意清潔棉田，對重病田或輕病田都有減少土壤菌源和降低危害的顯著效果。此外，深施基肥和磷、鉀肥，及時排水、合理灌溉等，都能增強棉株抗病力，減輕枯萎病的危害。抗蟲棉前期抗蟲性強，下部蕾鈴均可成鈴，這樣會過早消耗棉株養分，降低棉花抗病性，誘發枯萎病和早衰，故最好在現蕾後去葉枝時去除第1~2果枝，同時將下部3個果枝花蕾數控制在3個以內，促進棉株營養生長，並增強棉株抗病力，減輕枯萎病危害。
4. 化學防治
田間發現零星病株後，應立即拔除帶出田外燒燬，並對病穴及其周圍進行消毒。嚴重地塊可採用噴霧與灌根相結合的方法。用3%廣枯靈水劑300~500倍液、或用12.5%治萎靈200~250倍液加磷酸二氫鉀、綠風95噴霧，5~7天噴1次，連噴3~4次。灌根，每株用藥液50~100ml，可減輕危害，控制病害蔓延。未發病地塊，應噴灑黃腐酸有機肥或綠風95、磷酸二氫鉀等葉面肥，以提高棉株抗病力，減少發病，7~10天噴1次，連噴2~3次。
1. 選擇抗病品種
如中棉所24號、27號、35號、36號、豫棉19號、新陸早9號、10號等基本上都是抗病品種，對枯萎病的防治上都起到了至關重要的作用。但抗病品種應不斷篩選，同時與優良的栽培措施相結合，即良種良法配套，這樣才能使抗病性得到充分發揮。
2. 實行輪作倒茬
枯萎病菌在土壤中存活年限雖然相當長，但在改種水稻的淹水情況下較易死亡。合理的輪作倒茬，特別是與禾穀類作物輪作，可以顯著減輕發病。重病田改種玉米和小麥4年後，枯萎病發病率壓低至1%以下，而且消除了死苗現象。此外，油菜壓青對棉花枯萎病也具有一定防治作用，此方法簡單易行，有很大可行性。
3. 加強栽培管理
枯萎病病殘體能傳播病菌，加重危害，因而注意清潔棉田，對重病田或輕病田都有減少土壤菌源和降低危害的顯著效果。此外，深施基肥和磷、鉀肥，及時排水、合理灌溉等，都能增強棉株抗病力，減輕枯萎病的危害。抗蟲棉前期抗蟲性強，下部蕾鈴均可成鈴，這樣會過早消耗棉株養分，降低棉花抗病性，誘發枯萎病和早衰，故最好在現蕾後去葉枝時去除第1~2果枝，同時將下部3個果枝花蕾數控制在3個以內，促進棉株營養生長，並增強棉株抗病力，減輕枯萎病危害。
4. 化學防治
田間發現零星病株後，應立即拔除帶出田外燒燬，並對病穴及其周圍進行消毒。嚴重地塊可採用噴霧與灌根相結合的方法。用3%廣枯靈水劑300~500倍液、或用12.5%治萎靈200~250倍液加磷酸二氫鉀、綠風95噴霧，5~7天噴1次，連噴3~4次。灌根，每株用藥液50~100ml，可減輕危害，控制病害蔓延。未發病地塊，應噴灑黃腐酸有機肥或綠風95、磷酸二氫鉀等葉面肥，以提高棉株抗病力，減少發病，7~10天噴1次，連噴2~3次。