水體中藻類和菌類之間是對立統一的關係。從生態作用的角度看，水中的藻類和菌類之間是相互抑制又相互利用的對立統一的關係，菌類分解有機物產生營養鹽提供給藻類，藻類吸收營養鹽生產有機物提供給菌類；菌類分解掉水中的有機物後逐漸死亡，使水質逐漸清潔，又促進藻類的繁殖；藻類吸收掉水中的營養鹽後也會逐漸死亡，死亡的藻類會使水中的有機物增加又促進菌類的繁殖；清潔的水質會使藻類吸收更多的太Sunny促進藻類的繁殖，也會透射更多太Sunny中的紫外線而抑制菌類的繁殖；汙濁的水質使藻類不能吸收太Sunny而抑制藻類的生長，也會遮擋太Sunny中的紫外線而促進菌類的繁殖在正常情況下藻類和菌類保持著自然水體中的有機物與營養鹽、水質的清潔與汙濁、上下游食物鏈等複雜的生態平衡，並能保持自然水體的自淨；人類汙水的排入就會打破這種平衡，造成各種水質災害和環境災難。

一時半刻真說不清：水中藻類和菌類是非常多的，既有互生也有雙互抑制又是有依存。首先是異養菌吧會把水中腐敗植物死去藻類魚糞分解成氨氮化合物，接著硝化細菌或光合細菌把氨氮轉化為植物和藻類可利用的硝酸鹽，還有一類反硝化菌也會吸收利用硝酸鹽。這裡藻類與異養菌算是互生了，與硝化菌是依存吧，反硝化側是競爭抑制了！大量的光合細菌也可以抑制藍藻有助矽藻生長。就懂那麼一點獻醜了歡迎補充！