蛋白質如何發現其作用物件？”，這是一個十分重要的問題，應該轉化為“酶如何發現其作用物件，如何作用？”。這個問題已經解決，主要由以下幾個方面決定:
（1）蛋白基礎單元的介面性質和其形成組合體的介面性質；
（2）密度梯度形成特性或液體內部流形變化；
（3）能量密度變化；
（4）被作用物件與之發生碰撞的機會；等等。
在人體中，蛋白的形成在前一個問題中已經解釋，其作用挺有意思的，是治療的基礎，中醫藥調節理論的基礎，也是免疫理論當然的基礎。
·“蛋白質”是在“細胞體”“吞噬”進化過程出現的，在自然界的“無機催化”的條件下是不可能出現的，但是，“氨基酸”這樣的“有機小分子”是可以出現的。“氨基酸”與“鹼基”的進化基本上是同步的，在地球上的環境下，它們能夠被“吞噬”進入原始的僅含有“磷脂雙分子層”的細胞體中，並能夠適應細胞體的濃度梯度的環境下，使得蛋白質和基因小片段得以形成。在密度梯度變化的作用下，生成的部分“蛋白質”能夠鑲嵌進入“磷脂雙分子層”，使得生物進入“爆發式”進化階段。
·在“無機催化”進化到“有機催化”的過程中，因“水”的特質在運動梯度的作用下，產生的“鹽”密度梯度，對此進化過程起到了決定性的作用。前面已經解析了，具有“催化”能力的介面，其尺度（縱向上，垂直於介面）相對寬泛，且在比較窄（相對集中）的“能空間體”群密度的變化下，能引起較大的“介面”的尺度變化。球體的“介面”一般在均一程度較好，在受到“能量空間體”群的作用後，恢復的效能也越強，這也是一般“催化劑”的最佳選擇。因此“有機催化劑”最小組成單元應是“閉合”的“球”介面，球蛋白符合這種特性（蛋白質可以形成“晶體”）。
·在“介面”體系中，“固體-液體”的“介面密度”和可恢復性一般來說是最佳的，因此有機物能作為高效的“催化劑”，需要具有“晶體”性質，且可以組合成幾種“介面”，使其具有更廣普的“催化”效果。
·因此，“蛋白質”是最佳的“催化”載體，一旦“蛋白質”作為“催化劑”進化開始形成，細胞體就進入了具有生物學活性階段，使得生物細胞生殖開始，細胞體進化進入“基因突變”階段，加速了生物進化的過程，單細胞或（細胞數量較低的）多細胞生物可以透過“吞食”蛋白質等獲得氨基酸和多肽，縮減了生物合成的路徑和效率，使得生物體有時間組合更復雜的內部體系，使得“巨大”生物體的出現成為可能。同時，糖和脂質的合成小細胞也得以形成，並在其被“吞噬”下進入大細胞體後，組合成代謝完整的細胞體系，使得有“器官”的動植物出現
蛋白質如何發現其作用物件？”，這是一個十分重要的問題，應該轉化為“酶如何發現其作用物件，如何作用？”。這個問題已經解決，主要由以下幾個方面決定:
（1）蛋白基礎單元的介面性質和其形成組合體的介面性質；
（2）密度梯度形成特性或液體內部流形變化；
（3）能量密度變化；
（4）被作用物件與之發生碰撞的機會；等等。
在人體中，蛋白的形成在前一個問題中已經解釋，其作用挺有意思的，是治療的基礎，中醫藥調節理論的基礎，也是免疫理論當然的基礎。
·“蛋白質”是在“細胞體”“吞噬”進化過程出現的，在自然界的“無機催化”的條件下是不可能出現的，但是，“氨基酸”這樣的“有機小分子”是可以出現的。“氨基酸”與“鹼基”的進化基本上是同步的，在地球上的環境下，它們能夠被“吞噬”進入原始的僅含有“磷脂雙分子層”的細胞體中，並能夠適應細胞體的濃度梯度的環境下，使得蛋白質和基因小片段得以形成。在密度梯度變化的作用下，生成的部分“蛋白質”能夠鑲嵌進入“磷脂雙分子層”，使得生物進入“爆發式”進化階段。
·在“無機催化”進化到“有機催化”的過程中，因“水”的特質在運動梯度的作用下，產生的“鹽”密度梯度，對此進化過程起到了決定性的作用。前面已經解析了，具有“催化”能力的介面，其尺度（縱向上，垂直於介面）相對寬泛，且在比較窄（相對集中）的“能空間體”群密度的變化下，能引起較大的“介面”的尺度變化。球體的“介面”一般在均一程度較好，在受到“能量空間體”群的作用後，恢復的效能也越強，這也是一般“催化劑”的最佳選擇。因此“有機催化劑”最小組成單元應是“閉合”的“球”介面，球蛋白符合這種特性（蛋白質可以形成“晶體”）。
·在“介面”體系中，“固體-液體”的“介面密度”和可恢復性一般來說是最佳的，因此有機物能作為高效的“催化劑”，需要具有“晶體”性質，且可以組合成幾種“介面”，使其具有更廣普的“催化”效果。
·因此，“蛋白質”是最佳的“催化”載體，一旦“蛋白質”作為“催化劑”進化開始形成，細胞體就進入了具有生物學活性階段，使得生物細胞生殖開始，細胞體進化進入“基因突變”階段，加速了生物進化的過程，單細胞或（細胞數量較低的）多細胞生物可以透過“吞食”蛋白質等獲得氨基酸和多肽，縮減了生物合成的路徑和效率，使得生物體有時間組合更復雜的內部體系，使得“巨大”生物體的出現成為可能。同時，糖和脂質的合成小細胞也得以形成，並在其被“吞噬”下進入大細胞體後，組合成代謝完整的細胞體系，使得有“器官”的動植物出現