埃及主要有三大神學體系，一是赫利奧波利斯神學體系；二是赫爾莫波利斯神學體系；三是孟非斯神學體系。

赫利奧波利斯神學體系是出現最早，體系最完整的神學，赫利奧波利斯神學體系宣揚的是九神團，包括拉神、舒神、塔鞭努特、伊西斯、賽特、娜美提斯、奧裡西斯、蓋布、努特。古代埃及太陽有很多種稱謂，如凱普麗是早上的太陽，阿圖姆一般表示晚上的太陽，拉表示中午的太陽，埃及還把神放在一次稱呼，為複合神。阿圖姆創造了諸神，如舒神又是風之神，泰富努特溼氣女神，頭頂王座的伊西斯神，賽特混亂之神等。在金字塔文中，阿圖姆為造物主，是宇宙的創造者。

九神的關係是，阿圖姆神在混沌之水中完成了自我的創造，自我創造之後，創造了舒神和塔鞭努特，舒神和塔鞭努特又創造了蓋布和努特，其中蓋布為大地之神，自然環境由他這裡出來，然後努特是他的妻子是天空之神。蓋布和努特一起創造了伊西斯、奧裡西斯、賽特、娜美提斯。他們既是兄弟姐妹也是夫妻。奧裡西斯、賽特有一段王位之爭的故事，其中值得一提的是奧裡西斯在王位之爭中最終戰敗死亡，其妻子伊西斯走遍各個地方收集奧裡西斯的肢體，最終奧裡西斯復活，但其復活的形象就是木乃伊的形象。

赫爾莫波利斯神學體系，類似於赫利奧波利斯神學體系，最大的區別是在該神學體系形式有變動，太陽神阿蒙神是最後一個環節，赫爾莫波利斯神學是四對夫妻神。

孟非斯神學體系產生較晚，該神學體系模仿了以上兩種體系。在該體系中普塔神是太陽神，普塔創世主，其中赫努斯是奧裡西斯和伊西斯的孩子，後來打敗了賽特奪得王位，成了埃及統治上下的神。

九柱神（Ennead）：埃及神話中的九位主要神只。

拉（Ra）：主神，太陽神。其形象與阿蒙結合在一起。

休（Shu）：風神。

泰芙努特（Tefnut）：雨水之神。

蓋布（Geb）：大地之神。

努特（Nuit）：天空之神。

歐西里斯（Osiris）：冥王，也是農業之神。

艾西斯（Isis）：死者的守護神，生育之神。

賽特（Seth）：乾旱之神。

奈芙蒂斯（Nephthys）：死者的守護神。

主要的神：

阿蒙（Ammon）：主神。

阿吞（Aton）：朝之太陽神。

阿圖姆（Atum）：暮之太陽神，拉的別名。

荷魯斯（Horus）：法老的守護神，王權的象徵。外形為鷹頭人身。

阿努比斯（Anubis）：死神。外形為狼頭人身。

姆特（Mut；Golden Dawn，Auramooth）：阿蒙之妻，司掌戰爭，外形為獅子。

孔斯（Khons/Chons）：阿蒙與姆特之子，月神，亦司掌醫藥。

敏（Min/Menu，Amsu）：旅行者的守護神，亦司掌生產及收穫。

莫（Month/Mentu，Men Thu）：司戰爭，外形為鷹首人身。

圖特（Thoth）：智慧之神。

動物神：

貝斯特（Bast/Bastet）：貓神。

艾德喬（Edjo）：蛇神，下埃及的象徵及守護神。

海奎特（Heqet）：蛙神。

凱布利（Khepri）：聖甲蟲。

克奴姆（Khnum）：公羊神。

沙提（Sati）：大象之神。

塞克荷邁特（Sekhmet）：母獅之神。

塞勒凱特（Selket）：蠍子之神。

索貝克（Sobek）：鱷魚之神。

其他神：

安穆凱（Anuket）：水神。

阿匹斯（Apis）：司豐饒及生產之神，外形為公牛。

貝斯（Bes）：樂神。

哈波奎迪斯（Harpocrates/Hor-pa-kraat；Golden Dawn，Hoor-par-kraat）：孩提時荷魯斯的稱呼。

哈托爾（Hathor/Het-Heru，Het-Hert）：荷魯斯之妻，司愛情及豐饒。

伊姆賀特普（Imhotep/Imouthis）：醫藥及塔的守護神。

瑪特（Maat）：正義及秩序之神。

奈特（Neith/Net，Neit；Gold Dawn，Thoum-aesh-neith）：司智慧及戰爭之神。

奈荷貝特（Nekhbet）：上埃及的保護神。

布塔（Ptah）：創造之神。

奎特（Qetesh）：司愛情及美麗之神。

塞克（Seker）：司光之神。

紹席斯（Saosis）：擁有一棵洋槐樹的女神。許多神只（尤其是荷魯斯）都由她的洋槐樹中產生。

荷魯斯四子（Four Sons of Horus）：冥王身體的守護者。

艾姆謝特（Imset，Amset，Mesta）：荷魯斯四子之一，死者肝臟的保護者。

哈碧（Hapi，Golden Dawn，Ahephi）：荷魯斯四子之一，死者肺的保護者。

多姆泰夫（Duamutef，Tuamutef；Golden Dawn，Thmoomathph）：荷魯斯四子之一，死者胃的保護者。

凱布山納夫（Qebshenuf，Kebechsenef，Kebehsenuf，Qebehsenuf）：荷魯斯四子之一，死者腸的保護者。