2001-2002賽季

代表勇士出戰82場，場均拿到5.9分、3.9籃板和0.9助攻。創下自1995-1996喬·史密斯之後勇士新秀出場次數記錄，2002年3月16日生涯首次先發登場拿到13分和7籃板，2001年11月7日對陣猛龍拿到14分和10籃板。

2004-2005賽季

代表勇士出戰70場，場均拿到15.4分、10.8籃板和1.4助攻。場均進攻籃板3.6位列聯盟第5，防守籃板7.2位列聯盟第9。2005年2月23日對陣老鷹拿到賽季最高20籃板，2004年12月6日對陣凱爾特人拿到生涯最高30分並有15籃板。

2006-2007賽季

代表步行者出戰42場，場均拿到11.1分、6.1籃板和1.6助攻，代表勇士出戰26場，場均拿到8.9分、6.0籃板和2.3助攻。2007年1月27日對陣猛龍拿到12籃板生涯籃板總數達到3000，2006年11月25日對陣爵士拿到生涯最高5搶斷。

2007-2008賽季

2008年4月16日對陣尼克斯拿到生涯最高7助攻，2007年12月17日對陣尼克斯三分球8投5中創下生涯記錄。

2010-2011賽季

2010年8月11日，步行者隊在一四隊涉及五名球員的交易中，將墨菲交易到紐澤西籃網隊。

2011年2月23日，籃網隊將墨菲和一個次輪選秀權交易到勇士隊，換取布蘭登·賴特(Brandan Wright)和丹·加祖裡奇(Dan Gadzuric) 。

2011年2月27日，勇士與墨菲達成買斷協議，媒體稱凱爾特人、熱火等球隊均有意簽下墨菲，他們需要等待墨菲度過48小時的放棄狀態才可以與之簽約。

2011年3月1日，特洛伊·墨菲用電郵的方式告知ESPN網，他選擇加入波士頓凱爾特人隊。

2011年12月19日，洛杉磯湖人隊宣佈簽下自由球員特洛伊·墨菲。

2011-12賽季

2012年11月2日，達拉斯小牛隊宣佈簽下大前鋒特洛伊·墨菲。

2012年11月30日，小牛隊宣佈簽下老將德里克·費舍爾，同時裁掉了墨菲。