但是“是藥三分毒”，阿司匹林也不例外，一方面它並不是萬能的，另一方面它也會有副作用，這些副作用包括：對胃腸道粘膜會形成損害；牙齦出血時使用，有可能會加重出血傾向；孕婦在懷孕期內3個月時使用阿司匹林，可導致胎兒發育異常，如果孕婦長期服用阿司匹林，也可能會導致分娩延期或是分鐘分娩血的危險，一般醫生都嚴格囑咐孕婦在分娩前2至3周是絕對禁止使用的；近期剛動過手術的人或即將手術的人，都嚴禁使用阿司匹靈。

此外，在使用阿司匹林的時候，還需要注意劑量、服用頻率、劑型和病史問題，在醫學上都有嚴格規定。例如，對於劑量和頻率，醫學上的一致看法是，“小劑量”阿司匹林每天服用控制在75-325毫克，長期使用的話，則每天最佳劑量為75-150毫克，一天服用一次就夠了。

對於劑型也有規定。由於非腸溶片對胃黏膜有刺激作用，因此只適用於急性期首劑服用，或者作為解熱鎮痛藥物短期使用。長期服用的話，最好選擇經過緩釋的阿司匹林。

此外，對於有病史的人服用阿司匹林，也有相關指導。過去有消化道潰瘍或出血史者，尤其是過去服用非載體抗炎藥或阿司匹林時曾發生過類似病史者，應慎用和禁用。在用藥前最好先查血，長期服用者須定期複查血小板，有消化道症狀時應及時停藥並對症治療，密切觀察避免消化道出血。

最後是阿司匹靈如果和其它藥合併服用，也有一些需要注意的風險，需要患者事前瞭解，以便將風險降到最低：阿司匹林不要與維生系B1同服，因會引起胃腸道反應；阿司匹林與腎上腺皮質激素合用容易誘發潰瘍或出血；阿司匹林與口服抗凝藥雙香豆素合用易致出血；阿司匹林與磺醯脲類口服降糖藥合用引起低血糖反應；阿司匹林與丙戊酸、呋塞米、青黴素、甲氨蝶呤等弱鹼性藥物合用會增加各自的遊離血藥濃度。

最後，患者服用阿司匹林時，最好先諮詢醫生，針對上述可能發生的情況，得到了解或是確定不會有問題的答案後才服用，並嚴格按醫囑服用，不擅自胡亂使用。