一般來說，防治作物灰黴病應採用各種措施綜合防治，其中主要是升溫降溼（一般先將棚內氣溫升至30-32攝氏度或以上，之後再通風換氣，下午維持在25度左右，夜間不低於15度）；合理澆水（避開連陰雨天前澆水，澆水後應保持3-4天以上連續晴朗）；摘除病葉、病果、病莖，帶出田外集中燒燬；發病後，選用啶氧菌酯、啶醯菌胺、啶菌噁唑、農利靈丶克菌丹等殺菌劑噴霧，或者用速克靈、百菌清煙劑在傍晚封棚後燻煙防治。沾花時加入甲黴靈丶咯菌腈等殺菌劑以防止病菌藉機傳染。

灌根法也是一種防治灰黴病的方法。目前可選用以下藥劑：

（1）用10億個活芽孢丿g可溼性粉劑600-800倍液灌根，可防治灰黴病丶葉黴病、青枯病等多種病害，尤其是根部病害。它可與致病菌競爭營養，抑制病菌侵襲，誘導作物產生抗病性，促進作物根系和植株生長。不過菌類藥劑要防曬，施用時最好選在光弱的下午或陰天。

（2）寡雄腐黴菌是一種真菌殺菌劑。能在多種作物根圍定植，對多種病原真菌具有寄生和拮抗作物，誘導作物抗病。根據不同作物有專用型別，比如草莓專用、番茄專用、葉菜專用等。

（3）木黴菌又稱特立克、木黴素，是一種真菌製劑。在土壤中可與致病菌產生寄生、拮抗等多種作用。要在即將發病或發病初使用。製劑應防光曬，在陰天或光照弱的下午使用。一般用2億活孢子/g可溼性粉劑1500-2000倍液灌根，株用200-250毫升，澆後覆土。

以上菌類製劑均是以菌治菌，適宜在發病早期或未發病情況下抑制病害發生，在病害發生嚴重情況下，還是要選用藥劑噴霧等防治病害的。

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