【動畫目錄】　　 國語對照

　　01.進入學院

　　02.教室的恐怖

　　03.奇怪的忍者

　　04.院長的主意

　　05.消失的新兵衛

　　06.身份不清的忍者

　　07.快樂的黃金圖

　　08.新兵衛被懷疑

　　09.劍術名家花房牧之介

　　10.最了不起是誰

　　11.潛入九之一教室

　　12.新兵衛不見了

　　13.超一流忍者龍王丸

　　14.吉田村激戰

　　15.比武大賽

　　16.真摯的友情

　　17.秘使新九郎

　　18.松蘑城之行

　　19.不會游泳的海盜

　　20.相思病

　　21.巧遇不速之客

　　22.混合操練

　　23.蘑菇山遇險記

　　24.再顯雄風

　　25.爸爸的仇人

　　26.暑假取消了

　　27.院長的字畫

　　28.神的御告

　　29.舞竹城主

　　30.奪取糧食

　　31.第三協榮丸的船

　　32.稗田八方齋

　　33.新兵衛的煩惱

　　34.秋天軼事

　　35.大家的煩惱

　　36.寶刀極樂丸

　　37.珍貴的古茶碗

　　38.力鬥歹徒

　　39.骨肉相逢

　　40.神奇的蘑菇

　　41.引蛇出洞

　　42.神秘的新同學

　　43.接受新任務

　　44.功敗垂成

　　45.毒蛇和蠍子

　　46.風林火山

　　47.寶壇

　　48.物歸原主

　　49.復仇的忍者

　　50.院長的小豆湯

　　51.危險的行軍

　　52.山賊兄弟

　　53.密信

　　54.急性子與慢性子

　　55.阿丸的吝嗇

　　56.院長的稻草人

　　57.保衛一年三班

　　58.阿丸的困惑

　　59.門牌被盜

　　60.門牌的秘密

　　61.奇怪的小姐

　　62.本分的山賊

　　63.無鍋之炊

　　64.院長的草蓆

　　65.忍者父親

　　66.尋找父親

　　67.神秘的黑影

　　68.瀉肚藥

　　69.比武大賽

　　70.燒燬的選單

　　71.來歷不明的假幣

　　72.力擒罪犯

　　73.被盜的槍

　　74.德竹城之戰

　　75.補考

　　76.要回金魚

　　77.食堂被佔了

　　78.溫泉

　　79.黑黑不見了

　　80.還我黑黑

　　81.宗成寺

　　82.戰勝二年級

　　83.紙老虎強盜

　　84.攻其弱點

　　85.無聊的決鬥

　　86.賺錢有道的阿丸

　　87.食堂大娘感冒了

　　88.被冷落的新兵衛

　　89.想當老師

　　90.人馬術

　　其實這部動畫的國語版只有45集,每集分上下兩個部分,有的上下部分是獨立的兩個故事,故拆開後有90集.網上所謂的92集全集其實是有兩集重複的。