申時行是個膽小謹慎的人，不像張居正那樣敢一手遮天。作為明朝著名的“和事佬”，他在上任後以不變應萬變，始終週轉在文武百官與皇帝之間。

張居正實行的考成法，是他改革的主要內容。官員的工作指標要層層落實，完不成輕則罷官，重則坐牢，令各級官員威風喪膽。這種明代的打考勤，有效提高了官員的工作效率，是張居正的得意之作，既能提高各級官員的工作效率，又能避免懶政等行為，還能提高國庫的收入，一舉多得。

申時行上任後不久，就把張居正費盡九牛二虎之力推行的考成法廢除了。受益者首當是文武百官了，這也在一定程度上為申時行拉攏了一些支持者。當然，最高興的還是老百姓，因為考成法直接關乎到他們的溫飽。張居正擔任首輔的時候，他用皇帝的名義責令各府各縣必須按照規定全部繳足稅，不管天災人禍。痛恨張居正的人說他貪得無厭，京城和各地的庫房積存著大批現銀，而越來越多老百姓因為繳不起嚴苛的稅而流離失所，成為流民。就算天下下刀子，地方官員為了烏紗帽和政績，不會少收百姓一斤，百姓當不了農民就去當流民，尤其遇到連年災荒的地方，流民更是不計其數，社會矛盾逐漸增加。

據記載，萬曆年間的流民數量已經十分驚人。申時行毅然廢除了考成法，並開闢了大量田地，安置各地的流民耕種，社會矛盾得以大大緩解，流民的數量逐漸減少，廢除考成法，是申時行不多的功績之一。