不管是淡水魚還是海魚，其營養成分大體相同，總的營養價值很高。其次，魚肉中脂肪含量較少，而多由不飽和脂肪酸組成，人體吸收率可達95％，具有降低膽固醇、預防心腦血管疾病的作用。第三，魚肉中含有豐富的礦物質，如鐵、磷、鈣等；魚的肝臟中則含有大量維生素A和維生素D。

另外，魚肉肌纖維很短，水分含量較高，因此肉質細嫩，比畜禽的肉更易吸收。與營養價值很高但不易吸收的食物比起來，魚肉對人們的健康更為有利。

海魚營養、味道略勝一籌。營養成分差不多，並不等於二者的營養價值完全一樣。海魚在營養成分的含量上比河魚多，營養價值略勝一籌。

海里的營養極其豐富，尤其含有大量營養鹽，使海魚中礦物質和維生素含量更高。此外，海魚的肝油和體油中含有一種陸地上的動植物所不具備的高度不飽和脂肪酸，其中含有被稱為DHA（俗稱腦黃金）的成分，是大腦所必需的營養物質，對提高記憶力和思考能力十分重要。另外，海魚中的歐咪伽3脂肪酸、牛磺酸含量都比淡水魚高得多，對心臟和大腦具有保護作用。

從味道上來說，海魚的味道也比河魚鮮。這是因為海魚的遊動範圍和遊動時的力度比河魚大，使它的肌肉彈性更好，味道鮮美。而河魚吃起來有股土腥味，因為它們生長在腐植質較多的水裡。這樣的環境適合放線菌繁殖生長，細菌透過魚鰓侵入魚體血液中，並分泌一種帶有土腥味的褐色物質，這種土腥味在烹調過程中很難去掉。

吃海魚最好熟吃，生食會因異尖線蟲感染引發劇烈腹痛和過敏；吃淡水魚則要看其是不是從被汙染的水裡打撈上來的，被汙染的魚含有毒素，對健康會造成危害 。