針對波吉亞家族的“指控”有不少是缺乏依據的。人們不禁要問，為什麼波吉亞家族聲名掃地？這個“抹黑運動”背後的原因是什麼呢？縱觀文藝復興時期的歷史環境，主要原因可以歸結為三點。　　首先，波吉亞家族的西班牙裔出身導致了其在日後成為宣傳運動的攻擊物件。15世紀末至16世紀初，西班牙對於義大利北部事務的干預引起了義大利國內的強烈不滿，開始出現反西班牙宣傳運動，並將所有與西班牙有關的事物定義成壓迫、野蠻和殘酷的。波吉亞家族本身來自西班牙，而亞歷山大六世又協助西班牙更多地參與了義大利的國內事務，自然導致了義大利人的不滿。　　其次，文藝復興時期，教皇被認為是代表義大利本華人民利益的，而加里斯都三世和亞歷山大六世犧牲義大利人的利益而壯大自己的家族，並請求國外勢力的幫助，破壞了當時義大利國內的政治力量平衡。因此，在後來的評論家和歷史學家的描述中，他們的形象自然是負面的。　　最後，也是最重要的原因，即波吉亞家族本身並不能稱之為成功，波吉亞家族勢力全依賴教皇的權力。教皇在世時獲得的權力太大，使得家族成員淡化了鞏固勢力的意識，也沒有與其他大家族建立聯絡。同一時期的皮科洛米尼、德拉·諾維、法爾內塞家族都一步步爬上了權力階梯的頂層，成為了義大利政治統治的主宰者。波吉亞家族仰仗教皇的權威和外國力量，並未把其他家族放在眼裡，也沒有尊重當時的政治格局，引起了其他家族的不滿。可以說波吉亞家族的勢力是“無本之木”，當亞歷山大六世去世後便土崩瓦解 。