變性並非是不可逆的變化，當變性程度較輕時，如去除變性因素，有的蛋白質仍能恢復或部分恢復其原來的構象及功能，變性的可逆變化稱為復性。許多蛋白質變性時被破壞嚴重，不能恢復，稱為不可逆性變性，比如說用金屬鹽、輻射使蛋白質變性。

重金屬鹽沉澱蛋白質

蛋白質可以與重金屬離子如汞、鉛、銅、銀等結合成鹽沉澱，沉澱的條件以pH稍大於等電點為宜。因為此時蛋白質分子有較多的負離子易與重金屬離子結合成鹽。重金屬沉澱的蛋白質常是變性的，但若在低溫條件下，並控制重金屬離子濃度，也可用於分離製備不變性的蛋白質。

臨床上利用蛋白質能與重金屬鹽結合的這種性質，搶救誤服重金屬鹽中毒的病人，給病人口服大量蛋白質，然後用催吐劑將結合的重金屬鹽嘔吐出來解毒。

有機溶劑沉澱蛋白質

可與水混合的有機溶劑，如酒精、甲醇、丙酮等，對水的親和力很大，能破壞蛋白質顆粒的水化膜，在等電點時使蛋白質沉澱。在常溫下，有機溶劑沉澱蛋白質往往引起變性。例如酒精消毒滅菌就是如此，但若在低溫條件下，則變性進行較緩慢，可用於分離製備各種血漿蛋白質。

加熱凝固

將接近於等電點附近的蛋白質溶液加熱，可使蛋白質發生凝固(coagulation)而沉澱。加熱首先是加熱使蛋白質變性，有規則的肽鏈結構被開啟呈鬆散狀不規則的結構，分子的不對稱性增加，疏水基團暴露，進而凝聚成凝膠狀的蛋白塊。如煮熟的雞蛋，蛋黃和蛋清都凝固。