應該是把柯南當成阿笠博士的親戚來看待，也有喜歡。

目前小五郎對柯南和新一的認知是：

1.柯南是阿笠博士遠方親戚的小孩，母親是江戶川文代（《江戶川柯南誘拐事件》）

2.柯南的知識面非常廣泛（電視少年），也經常在案件現場指手畫腳（每一集都如此）

3.新一是女兒的青梅竹馬，是少年偵探，但最近行蹤不明（《女高中生的秘密咖啡館》）

而小五郎對“沉睡的小五郎”的認知則是：他是我的第二人格（《小五郎在酒吧》）

所以我認為毛利小五郎對柯南沒有很明確的認知，至少是沒有將他和新一聯絡起來，畢竟柯南有自己的母親還給小五郎一筆錢當撫養費，而且在《危命的復活》新一和蘭在旋轉餐廳約會時，他和柯南（灰原哀假扮）在一起。

我不認為毛利小五郎具有特工身份和隱藏任務，他的高光時刻侷限在和英理和蘭，或者自己的朋友的相關劇情，而且實際上在很多時候仍需要柯南的點撥。其實他的推理能力高的時刻主要是因為涉案的是自己重視的人，所以會更加仔細的搜尋證據，其實在把證據串成線得到答案的過程中往往還是柯南在起作用（最明顯的是《最糟糕的生日》）。而在《妃英理綁架事件》中他幾乎沒有貢獻推理，只是最後爬水管耍了一下帥。

大家都知道柯南一直都寄宿在小蘭家裡，與毛利小五郎也一直相處很久，毛利一直說柯南臭小子什麼都不懂，但是同時也非常關心柯南，柯南一旦出了事情，毛利一直都是非常關心，可以說毛利是嘴上鄙視著柯南，心裡還是非常關心他的。

柯南心裡也一直吐槽著毛利，感覺兩個人相處的非常有意思，毛利對待柯南的感情既像父子，又像冤家對手吧！