新鮮香菇必須避免在強光下儲存。

必須避免在強光下貯存香菇，同時也要避免用透光材料包裝。密封貯存法 可用鐵罐、陶瓷缸等可密封的容器裝貯香菇，容器應內襯食品袋。要儘量少開容器口，有條件的可用抽氧充氮袋裝貯。

香菇存放時應確保密封，不要空氣接觸以免軟化，避開高溫及日曬處，放在陰涼的地方，用較厚的塑膠袋小包裝存放。 受潮再烘乾或日曬儲存香氣及口感。生鮮未烘乾之香菇避免沾水，可延長儲存期限。

將生鮮香菇放入冰箱之冷凍庫存放，亦可延長儲存期，使用前解凍即可，但不可反覆冷凍。香菇必須在低溫通風處貯存，有條件的可把裝香菇的容器密封后置於冰箱或冷庫中貯存。香菇含水量高時容易氧化變質，發生黴變。

1、冰箱儲存香菇：可以用保鮮袋包裝好香菇放到冷藏室，也可放到冷凍室。在冷藏室一般能儲存7～10天，在冷凍室一般能儲存5～10月。

2、鹽水浸泡香菇：鹽水濃度10%左右，將新鮮香菇浸泡在鹽水中，能儲存10～15天。食用時用清水浸泡3～5小時，漂洗一大部分食鹽即可。

3、焯水儲存香菇：用開水焯水3～5分鐘後撈起，用保鮮袋包好，放進冷藏室，能放10～15天，放進冷凍室可放8～12個月。

4、晾曬儲存香菇：將新鮮香菇放在太陽下暴曬直到曬乾，包裝好可儲存12～18個月。