1、北府兵自組建以來，基本採取募兵先募將的方式，將留滯在江淮地區的流民宗族聚攏起來。祖逖等即是例子。其發展歷史中多次經歷聚而復散的狀況。如沒有強有力且長期浸淫其中的領導人，很易再次散離。2、北府兵經多次戰亂，人才和兵員面臨枯竭，劉裕本來就是北府殘留的最後一股力量。在東晉中後期，西府兵往往比北府發揮更大作用。3、劉裕非士家大族背景。時代機遇造就了其走上政治最高臺，統治基礎並不穩固。登基後，也需要對於日益沒落的北府兵也多行改造，改變掌軍大將權勢過重的局面。

應該是兩個原因

一上層原因：真正應了一句話 千軍易得，一將難求，劉裕、檀氏兄弟都是超一流的名將，名將已死，剩下就是烏合之眾了，人才將才可遇不可求...

現在看來，在劉裕等次等士族中的優秀者分化出來上升為皇權的同時，如檀道濟這樣的多數北府兵集團的次等士族仍保持了在大的政治鬥爭面前無所適從的特點，雖有強大的力量，卻認不清方向，不會利用，只能充當皇權和其他權臣手中的工具，正如劉牢之等人只能成為門閥士族的工具。“雖有幹略，而無遠志”可能是他們的普遍性格，也是釀成他們悲劇的根源。然而，檀道濟擁有的北府勢力在廢立中表現出來的力量，畢竟使宋文帝感到了對皇權的潛在威脅。在討伐謝晦及元嘉七年伐北魏的戰爭中，文帝都讓自己的心腹，才能遠不及道濟的另一北府兵將領到彥之擔任前鋒或統率主力，就表現出了對道濟的防範

二下層原因

北府兵下層兵員，在此前的歷次內部紛爭和對外作戰中也損失甚多。如元嘉三年(426年)，謝晦敗軍之時，他出鎮荊州時“精兵舊將，悉以配之”的三萬人馬，“大軍一時潰散”。元嘉七年(430年)到彥之北伐時，“甲卒五萬”，戰死被俘二萬餘。次年，檀道濟北伐時統兵在三萬以上，到回軍前夕，也已經“兵寡弱”了。這幾次戰鬥的主力，都應是北府兵。其損失至少也在5萬人以上。北府兵主要成分是京口、廣陵一帶的僑民，而京口的北來僑民人口總數也不過22萬。這其中，還有一大半老弱婦孺並非可參軍的人員。北方流民大量南徒主要在東晉前期，以後逐漸減少，兵員補充越來越困難。北府兵集團下層的支撐力量也日漸薄弱。

我認為一個主要的原因是劉裕在攻滅後秦後，急於篡位，自己帶兵南歸。而將只有十幾歲的兒子劉義真留在長安。而同時留在長安的沈田子和王鎮惡不和，最終內鬨，在大夏的進攻下，長安之地得而復失。北府軍幾萬精銳幾乎損失貽盡，出身北府軍的沈田子，王鎮惡，王修，朱齡石等大將都歿於此戰。 其實劉裕這次北伐看似成功，實際上卻把北府軍精銳都葬送了。幾萬精銳且不說，光是能征善戰的將領也損失駭人。這時的北府軍基本己經被消耗得差不多了。如果劉裕能多活幾年的話，或許可以重建北府軍。可惜不到兩年劉裕就死了。在劉裕死後，還比較拿得出手的就數檀道濟了。可就是這麼一個人，也被劉裕的兒子劉義隆殺了。而劉義隆又沒有劉裕的雄才大略，充其量只是一個守成之主。其在位其間雖有元嘉之治，但其不通軍事，在武功方面鮮有建樹。更差點讓拓跋佛狸度江南下。

北府兵，中國歷史上戰鬥力最強悍的幾支部隊之一。

東晉立國，上游靠荊州，中間靠江淮水網屏障的建康，下游靠京口（今鎮江），這是西晉滅亡後“衣冠南渡”的三條主要線路。

東晉政府是皇族與士族共治，兩者維持著微妙的平衡。皇族是司馬氏，但一直力量薄弱，必須依靠大族；士族也經歷了幾大家族輪流坐莊，典型的有王導、庾亮、桓溫、謝安四大執政。東晉一直風雨飄搖，外敵不說，內亂也比較嚴重，初期有王敦、祖約，後期有桓玄、孫恩、盧循等。

王敦、桓溫先後任荊州刺史，遙制建康，王敦曾攻破建康、桓溫差點稱帝，朝廷沒有其他軍事力量能抗衡。謝安時期，前秦逐漸強大，朝廷感覺到必須建立一支強大的軍隊，對內可制衡各種勢力、對外可保國家安全。在這種背景下，公元377年，命謝玄為南兗州刺史，負責組建新軍，把大本營從京口移到廣陵。當時京口稱北府，所以這支軍隊便名北府兵。

北府兵的兵將基本來自北方，士兵對北方“五胡”有切齒之恨。組建第三年，前秦猛攻東晉西線重鎮襄陽，同時命兗州刺史彭超率兵十餘萬進攻東晉的彭城等地。北府兵救援彭城，一路勢如破竹，秦軍大敗。

北府兵參加的最大戰爭是淝水之戰。秦軍前鋒梁成率軍五萬屯洛澗，北府兵驍將劉牢之率兵5000夜襲梁成，殲敵一萬五千，斬主將梁成，東晉士氣大振，奠定了戰爭勝利的基礎。淝水戰役，東晉投入兵力八萬五千，其中北府兵五萬左右，戰爭的勝利固然有一些幸運因素在裡面，但北府兵的英勇作戰非常關鍵。

淝水戰後，謝玄帶北府兵北伐，收復了今河南、山東、陝西南部等廣大地區。

謝玄執掌北府兵十年，以後的十五年掌握在劉牢之手中。劉牢之軍事能力很強，但政治是白痴，最後投奔稱帝的桓玄，北府兵被桓玄吞併，劉牢之自殺。

北府兵最後一顆明星是大名鼎鼎的劉裕。桓玄稱帝后，他在京口與一批老北府兵的中下級軍官，組建了一支幾千人的小部隊，奮勇西進，一舉蕩平桓玄。劉裕掌權後，自己稱帝，東晉滅亡。