有一種理論就認為，病毒來源於一種環狀DNA（也稱為質粒），其能夠獨立複製，並且在不同細胞之間穿梭，將遺傳物質從一種有機體傳遞到另一種有機體，比如，有些質粒就能攜帶抗生素耐藥性的基因，這種理論認為，質粒能從細胞中逸出，進入到另一種細胞中從而產生病毒顆粒。

另外一種理論則認為病毒能夠從一種極為複雜的自由生物進化而來，比如細菌或細胞；而最近一項研究結果表明，人類機體中對記憶非常重要的一種名為ARC的蛋白質能夠形成病毒樣顆粒，並且在不同細胞中能夠轉移RNA，或許類似的遠古蛋白質能夠在不同有機體的轉移過程中不斷進化。

最近研究人員在巴西的鹼湖中發現了這種名為Tupanvirus的巨大病毒，此類湖泊具有非常高的鹽度和pH值，其就類似於數十億年前地球上水生環境的狀況。相比其它已知的病毒而言，Tupanvirus病毒擁有全套的蛋白質製造機器，其並不依賴於宿主細胞而反之，這項研究重新激起了科學家們對起源於複雜自由活細胞中的病毒研究的興趣。

誰在先？

上述所有理論都認為細胞早於病毒而出現，而且在細胞存在的情況下病毒才會進行復制，然而有另外一種理論卻認為，病毒先於細胞出現，在史前世界裡，病毒都會以一種自我維持的實體存在，這種“古老機器”就能夠複製病毒的遺傳物質，隨著時間延續，這些史前的病毒或許就會形成複雜的有組織的結構，最終進化為細胞樣的實體結構。

隨機巧合產生的機率極其微小，因為生物體精密巧妙結構功能，有太多“智慧設計的痕跡”。如同鐘錶手機等產品，但是比鐘錶手機更加高階的多的多，顯然比鐘錶手機創造者更加的智慧。

另外機率問題面臨一個物理學定律的制約，熱力學第三定律熵值率。就是規律複雜的事物在沒有外來規律運動操控下，僅僅憑著自身的隨機運動，只能越來越混亂無規律，而不是相反。

簡單舉例來說，就是一杯純淨水裡面放一塊糖，隨著水分子糖分子的隨機運動，糖會溶解成為一杯水糖混合的糖水。 然後再不可能反過來，隨著糖水的分子運動糖和水分子自動分開，糖分子在水中凝聚成糖塊，而糖水成為純淨水！ 憑著任何人的常識都知道這絕無可能！

但是按照某些人以為的“萬能機率”，機率能產生一切。 但是在事實的物理規律面前，這隻能是一個幻想！是一種臆測。 因為沒有任何跡象證明萬能機率的存在。

如果連比人造的飛機手機鐘錶都高階的多的生物體都能憑機率產生， 那麼自然界產生一些接近或超過人造鐘錶手機汽車等複雜構建也必然更多了！ 應該被發現不屬於人造的自然隨機造的成品半成品許多的精密構建才是！

但是目前沒有發現任何一件！

而目前生物起源的進化論假說，其實就建立在機率的基礎上。 不過是機率漸變論，就是憑機率生物發生變異，再被“自然選擇”保留。再變異再保留，如此慢慢複雜。但是如今卻面臨不可簡化的複雜性的問題無法解決。

因為許多複雜的功能器官，不可能慢慢的一點點的變異再被選擇出來，而必須是“一步到位”。 只有一步到位，功能器官才能發揮功效，才能被自然選擇。 如同鐘錶手機裡面缺個零件或者位置比對就不管用！ 就會在自然選擇競爭面前被淘汰！ 而生物學物理學等常識又告訴我們，越是簡單的，越是頑強，越有“競爭”優勢。 所以複雜的生物結構除非一步到位，產生功能，一下形成競爭優勢，否則在你慢慢沒有任何優勢的轉變還是半成品的時候，就已經是劣勢而被淘汰了。 所以進化論無法解釋，面臨巨大困境。

任何生物，開始就兩種模式，融合適應，排斥適應，就和現實一樣，互利互通，外交政策，一種就是攻城掠地，剩者為王，最終目的就是生存下去，或同歸於盡，當第一個微生物分裂成兩個時候，就已經開始了曠日持久的萬年之戰

病毒的產生有三類學說：  

一、退化性起源學說

退化性起源學說認為病毒是細胞內寄生物的退化形式。這種細胞內寄生的產生原因可能是由於微生物對某種不能穿過細胞膜的代謝發生了嚴重依賴。在細胞內，這類寄生物可以在不影響其生存的情況下逐漸丟失部分生物學功能。

退化性起源學說可以把病毒的起源解釋為兩個階段：首先，寄生物在細胞內產生獨立複製的DNA質粒，然後，編碼寄生物亞細胞結構單位的基因發生突變，形成病毒的衣殼蛋白。隨著進化的發生，新獲得的可在細胞間轉移的特性被進一步選擇下來。

二、病毒起源於宿主細胞中的RNA和DNA成分的學說

病毒是正常的細胞組分在進化過程中獲得了自主複製的能力獨立進化而來的。該學說能解釋所有病毒的起源：DNA病毒起源於質粒或轉移因子；反轉錄病毒起源於反轉座子；RNA病毒起源於自主複製的mRNA。

三、病毒起源於具有自主複製功能的原始大分子的學說

該學說認為病毒起源於自主複製的RNA分子。核糖核酸多聚體具有自主複製的資訊和能力。由於發現RNA分子具有催化化學反應的能力使得RNA為生命和病毒的起源的學說變得更具有吸引力。

擴充套件資料

病毒的特點：

1、病毒的形體及其微小，必須在電子顯微鏡下才能觀察到，一般都能透過細菌濾器。

2、病毒沒有細胞結構，其主要成分僅為核酸和蛋白質兩種。

3、每一種病毒只含有一種核酸，不是DNA就是RNA。

4、既無產能酶系，也無蛋白質和核酸合成酶系，只能利用宿主活細胞內現成代謝系統合成自身的核酸和蛋白質成分。

病毒？是個廣義名詞，很籠統的，自然界說有十萬左右不同的蛋白結構，可以變化的有機化合物都稱作微生動物，人類歷史也不可定出那個是第一，也許人類身上肌體就有無教病毒蛋白合成，不同人群，人種人性，年0，環境，對自然界各種微生物細菌病毒的相處親和，耐受免疫程度都不同，問題複雜。無法說得清。病毒細菌，幼蟲，各類動物人類這些如何來的就是它如何來的，不分大小都是氨基酸為基本物質的構築。

真巧，科學家也想知道。病毒種類很多，因核酸和衣殼蛋白不同，在生物體內起作用的方式也不同，因此不同的病毒和可能有不同起源，具體哪一種是怎麼起源的，仍是未解之謎。

病毒的繁衍在於核酸，而核酸又有DNA、RNA的不同，而DNA和RNA又分別都有幾種型別，因此依據核酸分類病毒是比較合理的。

DNA的和人類的DNA起作用的方式一致，而RNA病毒卻有兩種方式，一種是RNA本身就是一種酶，可以直接利用生物的細胞器繁殖自身，另一種是進入細胞核心區域，先逆轉錄為DNA然後執行繁殖的生命功能。依據核酸的大概分類就有DNA病毒、RNA病毒以及逆轉錄的RNA病毒幾種。而DNA和RNA都有雙鏈或者單鏈，又有正義或者反義的構造，又多了幾種。

目前流行巴爾的摩分類方式，按照核酸的構成和作用規律，將病毒分為了7個大類，每一類病毒的作用方式都不相同，代表著它們的不同起源。

病毒僅僅由核酸和蛋白質衣殼的不同，因此不能獨自地繁衍自身，必須藉助細胞生物，也就是隻能借助動物、植物、細菌等細胞生命形式繁殖。

動植物和微生物的細胞構成是不同的，區別動植物細胞的關鍵是有無細胞壁，有細胞壁的細胞是植物細胞，由於細胞壁的存在，能感染植物的病毒起作用的機理自然與感染動物的病毒不同；而細菌雖然有細胞壁，但是細胞壁外也有鞭毛等結構，那麼主要感染細菌的病毒也就基本無感染動物或者植物的能力。

從病毒主要的感染物件來看，不同的病毒的起源也是不大相同的，生物細胞膜細胞壁上有很多抗原蛋白，而這些蛋白決定於自身的基因，病毒要感染細胞，就需要和這些抗原相互作用，這種特點又代表著不同的病毒有不同起源。

根據病毒核酸的作用方式，科學家認為DNA病毒可能起源於細菌的質粒；RNA病毒可能起源於細胞中脫出的核酸碎片。目前對於病毒的起源，總的來說有以下三種假說：

細胞起源理論：這種說法認為病毒原本是細胞生物中的某種細胞器，因為細胞會有破裂等現象，其中一些含有核酸的細胞器，因為變異等因素具備了重新識別細胞並向細胞中注入核酸繁殖自己的能力。

共同進化理論：病毒和細胞生命的主要構成物質都是核酸和蛋白質，而目前的生物起源假說也認為地球生命是無機物生有機物，有機物以某種方式作用產生了具備一定複製增殖能力的生命，病毒可能和細胞共同起源。

退化理論：細菌等微生物細胞體積已經夠小了，但是科學家也發現了一些體積更小的特殊細菌，它們的體積甚至只有細菌的數千分之一，寄生在微生物細胞內，而且它們的細胞內也缺乏一些細胞器，但是結構比病毒更接近細胞生命，經過漫長的過程，它們乾脆褪去了沒有啥作用的細胞器，只剩下核酸和某些蛋白，仍以感染或寄生細胞為主。

這些假說目前誰也說服不了誰，分析病毒的核酸序列，然後和各種細胞生物的核酸序列對比有助於摸清病毒的起源，但是病毒的種類很多，至今這些分析也沒搞清楚病毒到底怎麼來的，而且如上所述，所有的病毒也不大可能是同一起源。