高山族的民族語言種類繁多，但皆屬南島語系，一般也通用漢語普通話，部分也通用閩南話和客家話。

中國除了高山族外，還有佔族回輝人(未識別，佔族暫劃入回族，但其實除了宗教，共同點不多)使用的語言屬於南島語系，高山族的語言都屬於南島語系臺灣南島語族，分四大語群，北臺灣南島語群，鄒語群，南臺灣南島語群，東臺灣南島語群，但達悟人的語言卻不屬於臺灣南島語族，而屬於馬來-玻里尼西亞語族菲律賓語群巴丹語支，巴丹語支( Batanic）的語言包括達悟人的達悟語，伊巴丹人的伊巴丹語（Ivatan），伊巴雅人的伊巴雅語（ Itbayat），推測很可能達悟人不屬於高山族，而是巴丹族/ 巴布延族（Babuyan）的一個民系，和伊巴丹人與伊巴雅人屬於同一民族的不同民系，但目前法律上達悟人仍暫時識別為高山族，不過由於某些因素，所以省當局實際上，將高山族的大小民系分為16個獨立的民族，省內部分地方，還承認部分民係為新識別民族，臺南市和花蓮縣富里鄉的西拉雅族，但不為省中央不承認，另外部分漢化嚴重的民系，如苗栗縣的道卡斯，南投縣埔里的巴宰，南投縣埔里的巴布薩，巴布拉，洪雅，北臺灣的凱達格蘭。 。 。也希望回覆民族識別，多數被漢化的民系，屬於被稱為平埔族的一支。另外，寒溪語為泰雅語的一支和日語的混合語，香蕉白話則是閩南話和西拉雅語大武壠話的混合語。

中國使用馬來-玻里尼西亞語族的民族，除了達悟人，還有回輝人，回輝話為佔婆語的方言，屬馬來-松巴哇語群 佔語支。